Amasambililo ayapusanapusana aya kucingilila ifimenwa yalapeela ubutungulushi bwacindama ubwa kulondolola imisango ya fimenwa iyapusanapusana iya fyakulya, lelo ifyakusobela fyabo ifikankaala fyashala ifya kweshiwa. Apa, twabomfeshe ukufwailisha ukwabula ulubali (MS/MS) ku kufwailisha mu nshila iyalinga imisango ya fwaka iyacefiwako ukufuma ku fimenwa fimo fimo ukufika ku fipendo ne misango iyapalana, no kupanga impendwa iikalamba iya misango ya misango iyashintilila pa misango ya fimenwa mu mashiwi. Umusango wa kwesha ifishinka ifikalamba ifyakusobela ifyakucingilila bwino (OD) na ukusuntinkanya (MT) amasambililo. Amashiwi ayasangwa mu fyakulya fya miti yaleumfwana ne sambililo lya OD, lelo yalepusana ne fyo MT yasobela pa fyakulya ifya miti ifiletwa na balya ifya kulya ifya miti. Ukufuma ku cipimo icacepa ukufika ku cipimo icakulisha, icilangililo ca jasmonate caishibikwe nge cacilapo ukushininkisha OD, lintu icilangililo ca ethylene capeele ukuwamya kwasuko kwa fya kulya ifya mpanga ifyalembelwe na MS / MS.
Ifyakupangapanga ifya pa lwakwe ifyakwata imipangile iyapusanapusana efyo fibomba sana mu kwampana kwa fimenwa ne ncende, maka maka mu kucingilila abalwani (1). Ukupusana ukwa kupapusha ukwa mipangilwe ya fimenwa ukwaibela ukwasangwa mu fimenwa kwalengele imyaka iingi iya kufwailisha ukwashika pa fintu ifingi ifya mibombele ya fimenwa, kabili kwapanga umutande uukalamba uwa fisambililo fya kucingilila ifimenwa, ifili ifya kwaluka no kukula kwa fimenwa ukwa mibombele ya fimenwa ne fikoko. Ukufwailisha kwa pa lwabo kulapeela ubutungulushi bwacindama (2). Na lyo line, aya amasambililo ya kucingilila ifimenwa tayakonkele inshila iyalinga iya kutontonkanyapo, umo ukusobela kwacindami kwali pa mulingo umo wine uwa kupitulukamo (3) kabili kwakweshiwe mu kwesha ukutwala pa ntanshi umusango ukonkelepo uwa kutunguluka kwa masambililo (4). Ukucepelwa kwa mibombele kulakanya ukulonganika amashiwi ku fiputulwa fya fimenwa ifya pa lwabo no kufumyamo ukufwailisha kwakumanina ukwa fimenwa ifya pa lwabo, eico ukucingilila ukulinganisha kwa fiputulwa ifikankala ku kulunduluka kwa fisambililo (5). Ukubula amashiwi ayasuma aya fyakupangapanga ne ndalama shalinga ukulinganisha imibombele ya fyakupangapanga pakati ka mabumba ya fimenwa ayapusanapusana kulacilinganya ukukula kwa basambilila sayansi mu mpanga.
Ukutunguluka kwa nomba line mu fyakupangapanga ifyakupangapanga (MS/MS) kuti kwalondolola bwino bwino ifyakupangapanga ifyakupangapanga mukati na pakati ka misango ya fimenwa ifyapeelwa, kabili kuti fyasankanishiwa ne nshila shakubomfya pa kupenda ukupalana kwa mipangilwe pakati ka ifi ifisankanishiwa ifyakosa. Ukwishiba kwa pa ntanshi ukwa fya kemikali (5). Ukubikwa pamo kwa matekinoloji aya pamulu mu kupitulukamo na mu kompyuta kulapeela umusango uwalinga uwa kwesha kwa nshita itali ukwa ifishinka ifingi ifyasobelwe ifyacitwa na masambililo ya fya mweo na aya kwaluka kwa fya kulya ifyapusanapusana. Shannon (6) atendeke isambililo lya mashiwi pa muku wa kubalilapo mu lyashi lyakwe ilya kubalilapo mu 1948, ukubika umufula wa kufwailisha amashiwi aya masamu, ayabomfiwe mu fifulo ifingi ukucila pa kubomfya kwa iko ukwa kubalilapo. Mu fya mibele ya bantu, isambililo lya mashiwi lyabomfiwa bwino bwino ku kupima ubutantiko bwa mashiwi ayasuminishiwa (7). Mu kufwailisha kwa fyalembwa, isambililo lya mashiwi lipituluka mu fya kwaluka fyonse mu fyalembwa (8). Mu kufwailisha kwapita, twabomfeshe umusango wa fipendo uwa mashiwi ya kusambilila ku fya kulya ku kulondolola ubumanyi bwa fya kulya ubwa musango wa fipimo mu fimenwa (9). Apa, tulasankanya umulimo uwashintilila pa MS / MS ne mitantikile ya fipendo iya cisambilisho ca mashiwi, iyaishibikwa ku misango yalekanalekana iya fya kulya mu ndalama sha lyonse, ukulinganisha ifishinka fikalamba ifya kusesema ifya cisambilisho ca kucingililwa kwa fimenwa ica metabolome iyaletwa na balya ifya kulya ifya mpanga.
Imitantikile ya fimenwa iya kucingilila ifimenwa ilingi line ilasanshamo kabili kuti yaputulwa mu fiputulwa fibili: ifyo ifiesha ukulondolola ukwakanishiwa kwa fimenwa ifya misango yalekanalekana ukulingana ne milimo ya kucingilila, pamo nga ukucingilila bwino (OD) (10), ukufwaya ukucincintila (MT) (11) ) Ne mimonekele ilyo ifimenwa fimbi fipilibuka mu, ukusangwa kulakuma ukukula kwa fimenwa no kulonganika kwa fimenwa ifya pa lwabo, pamo nga carbon: ukulingana kwa fya kulya (13), ukukula kwa musango wa kukula (14 ), no kukula no kwaluka ukwalinga (15). Amabumba yabili aya fisambililo yali pa fipimo fyapusanapusana ifya kupitulukamo (4). Na lyo line, amasambililo yabili ayakwata imilimo ya kucingilila pa mulingo wa mibombele yacilapo ukulanshanya pa lwa fimenwa ifipanga no kucingilila ifishingacitika: isambililo lya OD, ilyasumina ukuti ifimenwa filabika indalama mu fya kucingilila ifya kemikali ifya mutengo nga cakabilwa fye, ku ca kumwenako, ilyo fyalya ilyo inama ya mpanga yasansa, kanshi, ukulingana na umulimo wapeelwa (10); MT hypothesis isosa ukuti takwaba axis wa kwaluka kwa fya kulya ifyalungama, lelo ifya kulya filaaluka ukwabula ukufwaya, eico ukupanga amaka ya Kucingilila ifya kulya “ifya kucincintila” ifya kusansabika ifya kulya ifya mpanga. Mu mashiwi yambi, aya amasambililo yabili yacita ukusobela ukwapusana pa lwa kwalula kwa fya kulya ificitika pa numa ya kusansalikwa kwa fya kulya ifya mpanga: ubupalamano pakati ka kulonganika ifya kulya ifya musango umo ifyakwata umulimo wa kucingilila (OD) no kwaluka kwa fya kulya ukwabula ukutungululwa (MT) (11 ).
Icilangililo ca OD na MT tacisanshamo fye ukwaluka kwaletwa mu fya kulya, lelo na kabili ififumamo fya mu mpanga ne fya kwaluka ifya kulonganika ifi fya kulya, pamo nga ukulipila kwa kulinga ne fisuma ifya kwaluka kwa fya kulya mu cifulo cimo ica fya kulya (16). Nangu cakuti ifishinka fyonse fibili fyaishiba imilimo ya kucingilila iya fimenwa ifipya, ifingalenga nelyo tekuti fibe ifya mutengo, ukusobela kwacindami ukwapusanako ifishinka fya OD na MT kuli mu ntunga ya kwaluka kwa fimenwa ififumamo. Ukusobela kwa OD theory kwapokelela ukusakamana kwakwesha ukufika pali nomba. Aya amesho yasanshamo ukusambilila pa lwa mibombele ya kucingililwa iyalungama nelyo iyabula ukulungama iya fipimo fyapusanapusana ifya fimenwa ifyalinga mu fikuulwa fya kufimbilikisha ne mibele ya cifyalilwa, pamo pene no kwaluka mu cipimo ca kukula kwa fimenwa (17-19). Na lyo line, ukufika pali nomba, pa mulandu wa kukanakwata inshila ya kubombelamo na imitantikile ya fipendo iya kufwailisha kwa calo conse ukwa misango yalekanalekana iya fya kulya ifya mweo onse, ubupusano ubukulu ubwa kusesema pakati ka fisambililo fibili (ekutiila, ubutungulushi bwa kwaluka kwa fya kulya) bwashala ubwa kweshiwa. Apa, tulapeela ukupitulukamo kwa musango yo.
Icimonwa cimo icacindama ica fimenwa ifya misango yalekanalekana ni mipangilwe yabo iyapusanapusana pa fifulo fyonse ukufuma ku fimenwa fimo, impendwa ukufika ku misango iyapalana (20). Ukupilibuka kwa misango iingi mu fipimo fya fimenwa kuti kwamonwa pa cipimo ca cipendo ca bantu, lintu ubupusano bwa maka ubwa mibele ilingi line busuminishiwa pa cipimo ca misango (20). Eico, ukulekanalekana kwa fimenwa ecintu cikalamba ica misango yalekanalekana iya mibombele, ukulanga ukulingana ne fifulo fyapusanapusana, maka maka ifyo ififulo ifyakwata amaka yapusanapusana aya kusansalikwa ku fipesha amano ifya pa lwakwe ne fya kulya ifya mpanga ifyaishibikwa (21). Ukufuma mu lyashi lya kwa Fraenkel (22) ilya kutendekelako pa milandu ya kubako kwa fimenwa ifya misango yalekanalekana, ukulanshanya ne fimenwa ifingi kwamonwa nge fyacindama ifya kusalapo, kabili uku kulanshanya kwasuminwa ukuti kwapangile ifimenwa mu nshita ya kwaluka. Inshila ya kupanga ifya kulya (23). Ukupusana kwa misango mu misango yalekanalekana iya fimenwa kuti kwalanga ukulingana kwa mubili ukwapalana no kucingililwa kwa fimenwa ku misango ya fya kulya ifya miti, nga fintu imisango ibili ilingi line tayakwata ubupalamano ububi kuli cimo na cimbi (24). Nangu cakutila kuti caba icacindama ukusunga ubucingo ubusuma inshita shonse, ukwaluka kwa mubili ukwa mu nshita ukwapalana no bucingililo kulapeela ubusuma ubwaumfwika mu kuleka ifimenwa ukupeela ifipe ifyacindama ku fimbi ifyakubikamo indalama (19, 24), no kucingililwa ku kukabila kwa kupanga ifintu pamo. Ukuonaula kwa cishinka (25). Ukulundapo, uku ukubweseshamo kwa fimenwa ifya pa lwakwe ifiletwa na ifipe ifya kulya ifya miti kuti fyalenga ukusalanganya ukwaonaula mu cipendo (26), kabili kuti fyalanga ukubelenga ukwalungatana ukwa kwaluka kwa cifyalilwa ukwakulisha mu cishibilo ca jasmonic acid (JA), ici kuti casuminishiwa mu cipendo. Ifishibilo fya JA ifya pa muulu ne fya pa nshi fya makwebo pakati ka kucingililwa ku fya kulya ifya mpanga no kucimfyanya ne misango imo (27). Ukulundapo, inshila sha pa lwakwe isha kupanga ifya kulya ifipya shikapita mu kuloba kwa bwangu no kwaluka mu nshita ya kwaluka, ukutwala ku kwakanya kwa fya kulya ifinono pakati ka misango ya fimenwa iyapalana (28). Iyi imisango kuti yapangilwa bwangu mu kwasuka ukwaluka kwa misango ya fya kulya ifya mpanga (29), icipilibula ukuti ukupilibuka kwa misango ya fya kulya ifya mpanga ecintu cikalamba icitwala ubupusano bwa fya kulya ifya mpanga.
Apa, twapwishishe mu kulungatika amafya yakonkapo. (I) Bushe icipesha amano icalya ifya kulya fya mpanga cilapanga shani ifya kulya fya mu mpanga? (Ii) Ni shani fintu ifiputulwa fya mashiwi ifikulu ifya mibele ya fya kulya ifingapimikwa ku kwesha ukusobela kwa nshita itali ukwa kucingililwa? (Iii) Nga ca kutila kuti twabwekeshapo ukupanga ifya kulya fya mubili mu nshila iyapusanako ku ulelwisha, nga ca kuti e fyo caba, ni mulimo nshi umubili wa cimenwa ubomba mu kupanga ifyasuko fya mubili ifyalinga, kabili ni fimenwa nshi ifilenga ukuti ifintu fibe bwino ku kucingililwa? (Iv) Apo ifyasobelwe ifyacitwa na masambililo ayengi aya kucingililwa kuti fyalundwako ku fipimo fyonse ifya fipimo fya bumi, twaipusha nga ca kuti ukwasuka kwa fya kulya ukwalinga ukwaletwa ukufuma ku kulinganya kwa mukati ukufika ku kulinganya kwa misango? Pa kupwisha ici, twasambilile mu nshila iisuma pa lwa misango ya mabuula ya fwaka, iyo ili misango ya cimenwa iyakwata imisango ya fya kulya iyalinga, kabili ilabomba bwino ku fimenwa fibili ifya kulya ifya kulya ifya mpanga, ifimenwa ifya kulya ifya kulya ifya mpanga (Ms) (Ifya bukali nga nshi, ifya kulya sana) “umutundu”, ne fimenwa ifipokelela ifya Solanaceae na fimbi ifipokelela ifimenwa fimbi ne ndupwa Ifyakulya fya fimenwa. Twalipitulwikemo mu misango ya MS / MS iya fyakupangapanga no kufumyapo amashiwi ayalondolola imitantikile ya fipendo ukulinganisha amasambililo ya OD na MT. Panga amapu ayalungama aya kulanga ubunte bwa fishinte fya mubili ifikankaala. Ukufwailisha kwalundilweko ku cipendo ca bafyashi ba N. nasi na imisango ya fwaka iyapalana sana pakuti bapitulukemo nafimbi pa kwampana pakati ka misango ya fimenwa no kutwala OD.
Pa kuti tukwate mapu onse pa lwa bucindami bwa mabuula ya toaka wa fya kulya fya mu mpanga, twabomfeshe ukufwailisha ukwapangwa kale no kupenda umulimo wa kupenda pa kulonganika bwino bwino no kufumyapo amashiwi ayasuma aya MS / MS ayaibela ukufuma ku fya kupangapanga ifya miti ( 9 ). Iyi inshila iyapusana (iyaitwa MS/MS) kuti yapanga imisango ya fibumbwa ifishacindama, ifyo lyene kuti fyabomfiwa ku kufwailisha konse ukwa fibumbwa ifilondolwelwe pano. Iyi misango ya fimenwa iyapusanapusana, iyakwata amakumi ukufika ku makumi ya makumi ya fimenwa (mupepi na 500-1000-s/MS/MS pano). Apa, tulatontonkanya pa lwa mibele ya fya kulya mu cipimo ca mashiwi, no kupima ubupusano no bucindami bwa fya kulya ukulingana na Shannon entropy iya kwakanya kwa misango ya fya kulya. Ukubomfya inshila iyabomfiwe kale (8), twapende ifilangililo ifingabomfiwa ku kupima ubupusano bwa fya kulya (icilangililo ca Hj), ukusambilila kwa fya kulya (icilangililo ca δj) no kwaluka kwa fya kulya ifya mubili umo (icilangililo ca Si) . Ukulundapo, twabomfeshe ubutantiko bwa kutali (RDPI) ku kupima ubutuntulu bwa fya kulya ifya kulya ifya kulya ifya mpanga (Icikope 1A) (30). Mu kati ka iyi mitantikile ya fipendo, tulasunga imisango ya MS / MS nga ciputulwa ca mashiwi ya kubalilapo, no kubomba ubufulo bwa MS / MS mu citabo ca kwakanya imiku iingi, kabili lyene ukubomfya ubukata bwa Shannon ku kupima ubupusano bwa fya kulya ukufuma kuli ci. Ukusambilila kwa fyakulya fya mubili kupimwa ukupitila mu kwaluka kwa misango imo iya MS/MS. Eico, ukulundako kwa buvule bwa fiputulwa fimo ifya MS / MS pa numa ya kupanga ifya kulya fya mu mpanga kulapilibulwa mu kupanga ifya kulya ifya misango misango, RDPI no kusambilila, e kutila, ukulundako kwa δj index, pantu ifya kulya ifingi ifya pa lwabo filapangwa kabili index ya Si iyakulisha ilapangwa. Ukucefyako kwa Hj ukwa misango yalekanalekana kulangilila ukuti nangu impendwa ya MS / MS iyapangwa yalicefiwa, nangu ukusabankanya kwa misango ya misango kwaluka mu nshila iyacepako, lintu ukucefyako ukukanashininkisha kwa iko konse. Ukupitila mu kupenda kwa index ya Si, kuti cacitika ukulanga ifyo MS / MS ifitungululwa na fimo ifya kulya ifya kulya ifya mpanga, mu kupusanako, ifyo MS / MS tayasuka ukutungululwa, icilangililo cikalamba ica kupaatulako MT na OD ukusobela.
(A) Abalondolola imitantikile ababomfiwa ku fya kulya ifya miti (H1 ukufika ku Hx) MS / MS ukucincimusha kwa fishinka (RDPI), ukulekanalekana (Icilangililo ca Hj), ukusambilila (Icilangililo ca δj) no kulanga ifya kulya ifya kulya (Icilangililo ca Si). Ukuninina kwa musango wa kusambilila (δj) kulangilila ukuti, pa kati, ifyakulya ifingi ifya miti ikola fikapangwa, elyo ukucepa kwa misango yalekanalekana (Hj) kulangilila ukucepa kwa mipangilwe ya fyakulya nangu ukusabankanya ukwabula ukwalinga ukwa fyakulya mu mapu wa kwakanya. Umutengo wa Si ulepima nga cakuti umubili wa muntu walilungama ku mibele imo (pano, ifyakulya ifya miti) nangu ukusungwa pa mushinku umo wine. (B) Icikope ca mimwene ya bucingililo bwa kusesema ukubomfya amashiwi ya mimwene ya axis. Icisambililo ca OD cisobela ukuti ukusansa kwa fya kulya ifya miti kukakulisha ifya kulya ifya kucingililamo, eico ukukulisha δj. Pa nshita imo ine, Hj ilacepa pantu imibele ilapangwa cipya cipya ukulola ku kucefyako ukukanaishiba bwino bwino amashiwi ya fyakulya. Icisambililo ca MT cisobela ukuti ukusansa kwa nama ishilya ifya kulya fya miti kukalenga ukwaluka ukwabula ubutungulushi mu fya kulya, eico ukulundako Hj nge cilangililo ca kulunduluka kwa mashiwi ya fya kulya ayashishininkishiwa no kuleta ukwakanya kwa Si ukwabula ukufwaya. Kabili twapeele umusango uwasankanishiwa, MT iisuma, umo ifintu fimo ifyakwata imitengo ya kucingililwa iyakulisha fikakulilako (umutengo wa Si uwakulisha), lintu bambi balelanga amasuko ayapusanapusana (umutengo wa Si uwacepa).
Ukubomfya amashiwi ayalondolola ifya kulya, tulapilibula ifya kulya ifya OD ukusobela ukuti ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya (i) ukulundako ifya kulya ifya kulya ifya kulya (Si index) ukutungulula ifya kulya ifya kulya ifya kulya (δj index) Ukulundako kwa) amabumba ya fya kulya ayapusanapusana ayakwata umutengo wa fya kulya ifya kulya ( index) pa mulandu wa kwaluka kwa misango ya fya kulya ku kusabankanya kwa mubili ukwa leptin ukucilapo. Pa mulingo wa cimenwa cimo, ukusabankanya kwa Si ukwakonkanishiwa kulaenekelwa, apo icimenwa cikakulisha umutengo wa Si ukulingana no mutengo wa ciko uwa kucingililwa (Icikope 1B). Mu mushinku uyu, tulalondolola isambililo lya MT ukusobela ukuti ukusansamusha kukatwala ku (i) ukwaluka ukwabula ubutungulushi mu fya kulya ifitwala ku kucepako kwa δj index, na (ii) ukulundako kwa Hj index pa mulandu wa kulunduluka kwa fya kulya ifishaishibikwa. Nangu ukukanaishiba, uko kwingapimikwa na Shannon mu musango wa misango yalekanalekana. Ukukuma ku mipangilwe ya fya kulya, isambililo lya MT likasobela ukwakanishiwa kwa Si ukwabula ukufwaya. Ukubika amano ku kuti ifintu fimo ifibomfiwa mu mubili fyaba mu mibele imo imo, kabili ifintu fimbi tafili mu mibele imo imo, kabili umutengo wabo uwa bucingo uleshintilila pa ncende, na kabili twasondwelele umusango wa bucingililo ubwasankanishiwa, umo δj na Hj fyasalanganishiwa mu fibili ukulingana na Si Ukulundako mu mbali shonse, amabumba yamo aya bucingo ayakulisha, ayo yakakwata fye amabumba ya metabolite ayakulisha, ayakwata Si ukusabankanya (Icikope 1B).
Pakwesha ukusobela kwa cisambilisho ca bucingililo icapilibulwa pa mushinku wa cisambilisho ca mashiwi, twakushishe abasambilila (Ms) nangu abasambilila (Sl) utushishi utwa kulya ifya kulya pa mabuula ya Nepenthes (Icikope 2A). Ukubomfya ukufwailisha kwa MS / MS, twabuulile 599 ifishacindama ifya MS / MS (ifailo lya fishinka S1) ukufuma ku fyafuminemo ifya methanol ifya fipimo fya mabula ifyalonganikwe pa numa ya kulya kwa nshishi. Ukubomfya ifilangililo fya RDPI, Hj, na δj ku kumona mu menso ukubweseshamo kwa mashiwi ayasangwa mu fitabo fya MS / MS ifya kupanga kulasokolola imibele ya kusekesha (Icikope 2B). Icicitika conse ca kuti, nga fintu calondolwelwe na kalondolola wa mashiwi, ilyo ifipesha amano fyatwalilila ukulya amabuula, umusango wa kupanga cipya cipya ifya kulya fyonse ulakulilako mu nshita: ama-awala 72 panuma ya kulya ifya kulya ifya mpanga, RDPI ilakulilako nga nshi. Ukulingana no kucenjela ukwabula ukonaika, Hj yalicefiwe nga nshi, icacitike pa mulandu wa kulunduluka kwa mibele ya fyakulya, icapimilwe na δj index. Ici cimonwa cileumfwana ne fyasobelwe ifya OD, lelo tacikonkana ne fyasobelwe ifikulu ifya MT, ifisumina ukuti ukwaluka kwa musango yo (ukwabula ubutungulushi) mu fipimo fya metabolite kulabomfiwa nge ca kucingilila (Icikope 1B). Nangu ca kutila ifya kulya ifya mu kanwa (OS) ne mibele ya kulya iya ifi fibumbwa fibili ifya kulya ifya mpanga fyalipusana, ifya kulya fyafiko ifyalungama fyalengele ukwaluka kwapalana mu ntunga sha Hj na δj mu nshita ya kuseepa iya maawala 24 na 72. Ukupusana fye kwacitike pa maawala 72 aya RDPI. Ukulingana na ifyo fyaletwa no kulya kwa Ms, ukubomfya kwa mubili konse ukwaletwa no kulya kwa Sl kwali ukukulilako.
(A) Ukupanga kwakwesha: inkumba iyaishibikwa (S1) nangu abasambilila (Ms) abalya ifyakulya ifyakulya amabuula ayabula umucele, lintu ku fyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakupangapanga, OS ya Ms (W + OSMs) ilabomfiwa ku kubombela pa kupanga amabuula ayalinga aya cilonda. S1 (U + OSSl) utushishi nelyo amenshi (U + U). Ukukonkomesha (C) ni buula ilyashionaika. (B) Ukucincimusha (RDPI ukulingana ne citabo ca kucenjela), ukulekanalekana (Icilangililo ca Hj) no kucincimuka (Icilangililo ca δj) icapendelwe ku mapu wa pa lwakwe uwa fya kulya (599 MS / MS; failo ya fyebo S1). Intanda shilanga ubupusano ubukalamba pakati ka fyakulya fya nama ifyalungama ne bumba lya kuceeceeta (Ukufwailisha kwa basambi ukwa t ukwa babili, * P <0.05 na *** P <0.001). ns, te cacindama. (C) Inshita ya kupwisha indekisi iya cikulu (akabokoshi ka buluu, asidi ya amino, asidi wa cifyalilwa na shuga; failo wa fishinka S2) ne misango ya pa lwakwe iya fya kulya (akabokoshi akafitulukila 443 MS / MS; failo ya fishinka S1) pa numa ya kupanga ifya kulya ifya kulya ifya nyama. Iciputulwa ca ma langi cilosha ku 95% umupaka wa citetekelo. Icilangililo cilanga ubupusano ubukalamba pakati ka kundapa no kucenjela [ukupitulukamo kwa kwalula ukwa kwaluka (ANOVA), ukukonkwapo no bupusano ubukalamba ubwa cine cine ubwa kwa Tukey (HSD) ku kulinganya kwa pa numa ukwafulilako, * P <0.05, ** P <0.01 Na *** P <0.001]. (D) Ukuipekanya kwa fifulo fya kusansalikwa ne mibele ya pa lwabo iya fya kulya (ifya kumwenako ifyabwekeshiwapo ne miti yalekanalekana).
Pa kufwailisha nga cakuti ukuwamya kwa fimenwa pa mulingo wa fimenwa kulamonwa mu kwaluka kwa fimenwa umo umo, twabalilepo ukubika amano ku fimenwa ifyasambililwe kale mu mabuula ya Nepenthes pallens ayashininkishiwa ukukansana kwa fimenwa. Ama amide ya phenolic ni ma amide ya menshi ayasangwa pamo ayalonganika mu nshita ya kulya ifya kulya fya nama kabili yaishibikwa ukucefyako ukubomba kwa nama (32). Twafwaile ifishinka fya kubalilapo ifya MS / MS iyalinga no kupanga ifipimo fyabo ifya kulonganika (Icikope S1). Ica kupapa, ififuma ku phenol ifishasangwa mu kucingililwa ku fya kulya ifya mpanga, pamo nga asidi wa chlorogenic (CGA) na rutin, filacefiwa panuma ya fya kulya ifya mpanga. Mukupusanako, ifya kulya ifya miti kuti fyalenga ama amide ya phenol ukuba aya maka nga nshi. Ukukonkanyapo ukulya ifyakulya fibili ifya miti kwalengele ukuti kube imisango imo ine iya kucincimusha iya fimenwa ifipya, kabili iyi mibele yalimoneke bwino bwino ku kupanga ifimenwa ifipya ifya fimenwa ifipya. Ici cimo cine cikamonwa ilyo tulefwailisha inshila ya 17-HGL-DTGs, iyo ipanga impendwa iikalamba iya fya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya kulya (33), ifyo Ms.
Ubwafya ubungacitika mu kwesha kwa kulya ifya kulya fya nama ni ubupusano mu cipimo ca kulya amabuula ne nshita ya kulya ifya kulya fya nama, ifilenga ukuti cibe icakosa ukufumyapo ififumamo ifya nama ifya kulya ifiletwa ne filonda ne fya kulya ifya nama. Pakuti twingapwisha bwino imisango ya nama ishilya ifyakulya ifya misango yalekanalekana iya mabuula ayatuntulu, twapashanya ukuliisha kwa Ms na Sl larvae ukupitila mu kubomfya bwangu bwangu OS (OSM na OSS1) iyalonganikwa nomba line ku kupunkila kwalinga W ukwa fifulo fya mabuula ifyalinga. Iyi nshila iitwa ukundapa kwa W + OS, kabili ilalinganisha ukutendeka ukupitila mu nshita ya kutendekelako iya kwasuka ukwaletwa ne fya kulya fya nama ukwabula ukuleta ififumamo fya kukansana ifyapusana mu cipimo nelyo ubukulu bwa kuonaula kwa fipimo (Icikope 2A) (34). Ukubomfya ukufwailisha kwa MS / MS no kupenda umusebo, twabuulile 443 MS / MS imisango (ifailo lya fishinka S1), ilyasankanishiwe ne misango iyalonganikwe kale ukufuma ku fyakwesha ifya kulya ifyalungama. Ukufwailisha kwa mashiwi aya muli iyi MS / MS kwalangile ukuti ukubwekeshapo kwa mabuula ayapusanapusana ukupitila mu kupashanya ifya kulya ifya miti kwalangile ukucincimusha kwa OS (Icikope 2C). Mu kupalako, ukulingana no kundapa kwa OSS1, OSM yalengele ukuwamya kwa mibombele ya fya kulya pa maawala 4. Cisuma ukwishiba ukuti ukulingana ne fyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya, imibele ya fyakulya ifimonwa mu fifulo ifya misango ibili ukubomfya Hj na δj nga ifipimo no butungulushi bwa metabolome mukwasuka ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya mu nshita Ukulundako ukwalinga (Icilangililo 2D). Pa nshita imo ine, twapimine ifyaba muli amino asidi, asidi ya fimenwa na shuga (ifayilo lya fishinka S2) ku kufwailisha nga ca kuti uku kulunduluka kwalinga ukwa bumanyi bwa metabolome kwafuma ku kupanga cipya cipya ukwa mu kati ka carbon mu kwasuka ifya kulya ifya nyama ifyalinga (Icikope S2). Pa kulondolola bwino iyi mibele, twakonkenyepo ukuceeceeta ukulonganika kwa fya kulya ifya mubili ifyalandwapo kale ifya nshila sha 17-HGL-DTG. Ukubikwamo kwa OS ukwa fipe ifya kulya ifya miti kulapilibulwa mu misango yalekanalekana iya kupanga cipya cipya mu kati ka fya kulya ifya phenolamide (Icilangililo S3). Amamide ya phenolic ayakwata ifiputulwa fya coumarin na caffeoyl yasuminishiwa ukutungululwa na OSS1, elyo ama OSM yaleta ukutungululwa kwa fipimo fya ferulyl. Pa nshila ya 17-HGL-DTG, ukulekanalekana kwa OS ukupitila mu kupanga ifya kupangapanga ifya kupangapanga ifya kupangapanga fyasangilwe (Icilangililo S3).
Pa numa, twasambilile ubupusano bwa OS ubwalembwa ukubomfya inshita-iya-kukonkapo iya fishinka ifinono, ifipashanya ukubomfya kwa OSMs ku kundapa amabuula ya mabuula ya cimenwa ca rosette mu fya kulya ifya miti. Ukusalulula kwa mibele ya mibele mu kupalako kulakonkana ne mibele ya mibele iyabomfiwa muli ili isambililo lya fya kulya (35). Ukulingana no kupanga cipya cipya ukwa metabolome umo ukuwamya kwa fya kulya kwakulilako mu nshita, tumona ukuputuka kwa fya kulya ukwa pa kashita akanono mu mabuula ayaletwa na Ms, apo ukuwamya kwa fya kulya (RDPI) no kusambilila (δj) kuli pa 1 Kwaliko ukulundako kwakulisha mu maawala, kabili ukwaluka ukwakulisha (Hj) kwacefiwako pali iyi nshita, ukusokolola kwa BMPx ukwacilapo, ukusambilila kwa fyalembwa (Icikope S4). Imitundu ya fimenwa ifibomfya ifyakulya (nga P450, ifimenwa ifibomfya umubili, na BAHD) ilasangwa mu mulimo wa kulonganika ifimenwa ifyaibela ukufuma ku fipimfya ififuma ku fyakulya ifipya, ukukonka ifyo twalandapo kale ifya pamulu. Nga ca kusambililamo, inshila ya phenilalanine yalipitulwikwemo. Ukufwailisha kwashininkishe ukuti ifimenwa ifikulu mu fyakupangapanga ifya phenolamide fyalikwata sana OS mu fyakulya ifya miti ukulingana na ifimenwa ifishakokwa, kabili fyapalana sana mu misango yabo iya kulanga. Icilenga ukulemba MYB8 ne fimenwa fya mipangilwe PAL1, PAL2, C4H na 4CL mu mulu wa iyi nshila fyalangile ukutendeka kwa bwangu ukwa kulemba. Amabumba ya fimenwa ayabomba umulimo mu kulonganika kwa kulekelesha ukwa fimenwa ifipya, pamo nga AT1, DH29, na CV86, yalalanga imibele ya kucilikila iya nshita itali (Icilangililo S4). Ifimonwa pamulu filangilila ukuti ukutendeka kwa bwangu ukwa kusambilila kwa fyakulemba no kulundulula kwakukonkapo ukwa kusambilila kwa fyakupangapanga ni nshila iyabikwa pamo, iyo kuti yaba pa mulandu wa mibombele iyakonkana iya kutendekelako ukwasuka ukwa maka ukwa kucingilila.
Ukubwekeshapo kwa mishipa ya fimenwa kulabomba nge ciputulwa ca mafunde icisanshamo amashiwi ya fya kulya ifya miti ku kupanga cipya cipya imipangile ya fimenwa. Pa numa ya kufwailisha ifya kulya ifya kulya ifya kulya ifya mpanga, twapimine ukulonganika kwa misango ya fimenwa ifikankaala no kumona ukulanga kwa nshita pa kati ka fimenwa [Icilangililo ca Pearson (PCC)> 0.4] (Icikope 3A). Nga fintu cileenekelwa, amahomoni ya fimenwa ayapalana ne fyakupangapanga fyasuntinkanishiwa mukati ka mibombele ya mahomoni ya fimenwa. Ukulundapo, ukulinganisha kwa fya kulya (Si index) kwabikwa kuli iyi nshita ku kulanga amahomoni ya fimenwa ayaletwa ne miti iyapusanapusana. Ififulo fibili ifikulu ifya kwasuka kwa pa lwakwe ukwa fya kulya fya mpanga fyalembwa: cimo cili mu cibumba ca JA, umo JA (umusango wa iko uwa mulimo wa bumi JA-Ile) na fimbi ififumamo muli JA filalanga amano ya Si ayakulisha; umbi ni etileni (ET). Gibberellin yalangishe fye ukulundako kwalinga ukwa fya kulya ifya mpanga, lintu amahomoni ya fimenwa yambi, pamo nga cytokinin, auxin, na abscisic acid, yali ne fya kulya ifinono ifya kulya ifya mpanga. Ukulingana no kubomfya W + W fye, ukukulisha umutengo wa pa muulu uwa JA ififumamo ukupitila mu kubomfya kwa OS (W + OS) kuti kwapilibulwa mu cilangililo ca maka ica JAs. Mukukanacetekela, OSM na OSS1 ne fyakubikamo ifyapusana fyaishibikwa ukulenga ukulonganika kwapalana ukwa JA na JA-Ile. Mukupusanako na OSS1, OSM mu kulungatika kabili iya maka iyatungululwa na OSMs, lintu OSS1 tayakulisha ukwasuka kwa filonda fya pa nshi (Icikope 3B).
(A) Ukufwailisha kwa mibombele ya kulanshanya ukwashintilila pa kupenda kwa PCC ukwa kupanga amahomoni ya miti ayaletwa ne fya kulya ifya miti. Iciputulwa cimininako umusango umo uwa cimenwa, kabili ubukulu bwa ciputulwa cimininako Si index iyalinga kuli homoni wa cimenwa pakati ka miti. (B) Ukulonganika kwa JA, JA-Ile na ET mu mabuula ukuletwa no kundapa kwapusanapusana ukwalangishiwa ku mabala yapusanapusana: umusambo wa apricot, W + OSM; buluu, W + OSSl; ififiita, W + W; ubutuntulu, C (ukukonka) . Intanda shilanga ubupusano ubukalamba pakati ka kundapa no kucenjela (inshila shibili ANOVA ukukonkwapo na Tukey HSD ukulinganisha kwafulilako ukwa pa numa, *** P <0.001). Ukufwailisha kwa mashiwi aya (C) 697 MS / MS (ifailo lya fishinka S1) mu JA ukupanga ifya kulya ifya mweo no kuonaula kwa mimwene ya misango (irAOC na irCOI1) na (D) 585 MS / MS (ifailo lya mashiwi S1) mu ETR1 ne cishibilo ca ET icaonaika Amapange yabili aya kucenjela aya kulya ifya kulya ifya mpanga (amapange ya kupanga ifya kulya ifya mpanga) yatendeke. Intanda shilanga ubupusano ubukalamba pakati ka W + OS ukundapa no kucenjela ukwabula ukuonaika (inshila shibili ANOVA ukukonkwapo na Tukey HSD ukulinganisha kwafulilako ukwa pa numa, * P <0.05, ** P <0.01 na *** P <0.001). (E) Ama graph ayasalangana aya kukaanya ukwasalangana ukwa kusambilila. Amalangi yalemininako imisango yalekanalekana iya kwalula ifintu; ifishibilo fimininako inshila shapusanapusana isha kundapilamo: amaboko yatatu, W + OSS1; iciputulwa ca nshita, W + OSM; ukushinguluka C
Pa numa, tulabomfya umusango wa fimenwa ifyapilibulwa ifya Nepenthes (irCOI1 na sETR1) mu nshila shacindama isha JA na ET ukupanga ifya kulya (irAOC na irACO) no kumfwikisha (irCOI1 na sETR1) ukupituluka mu mibombele ya ifi fimenwa fibili pa fya kulya ifya kulya ifya mpanga. Ukulingana ne fyakwesha ifyapitapo, twashininkishe ukubikwamo kwa fya kulya fya mu mpanga-OS mu fimenwa ifyabula ifya kulya (EV) (Icikope 3, C ukufika kuli D) no kucepa konse ukwa Hj index iyaletwa na OSM, lintu index ya δj yalikuliile. Ubwasuko bwalicilapo ukumoneka ukucila ubwasuko bwaletwa na OSS1. Icilangililo ca mishilwa ibili ukubomfya Hj na δj nga ifishinka ifilanga ukukanakonka amafunde (Icikope 3E). Icimonwa sana ca kuti mu misango iyabula icishibilo ca JA, ukwaluka kwa fya kulya ifya mubili no kwaluka kwa misango yalekanalekana ukwaletwa na fya kulya ifya miti ikola mupepi no kupwa fyonse (Icilangililo 3C). Mukupusanako, ukumfwa kwa ET ukwa mutelelwe mu fimenwa fya sETR1, nangula ukukuma konse ukwa kwaluka mu fyakulya fya miti ikola kuli ukwacepako ukucila ukwa JA ukulanga, kucefyako ubupusano mu Hj na δj ifilangililo pakati ka OSM na OSS1 ukucincimusha (Icilangililo 3D na Icilangililo S5). . Ici cilelanga ukuti ukulunda pa mulimo ukalamba uwa JA ukupilibula ifishibilo, ET ukupilibula ifishibilo na kabili kulabomba nga ukuwamya kwa misango-iyapusanapusana iya fya kulya ifya kulya ifya miti. Ukulingana na uyu mulimo wa kulungika bwino, takwali ukwaluka mu fyakupangapanga fyonse mu fimenwa fya sETR1. Pa lubali lumbi, ukulingana ne fimenwa fya sETR1, ifimenwa fya irACO fyalengele ukupalana kwa misango yonse iya kwaluka kwa fya kulya ukwaletwa ne fya kulya ifya mpanga, lelo fyalangile amano yapusana nga nshi aya Hj na δj pakati ka mafya ya OSM na OSS1 (Icikope S5).
Pakuti twishibe ifya kulya ifya pa lwakwe ifyakwata ifya kusangwilako ifikankala ku fyasuko fya misango ya fya kulya ifya mpanga no kulungika ukupanga kwafiko ukupitila mu fishibilo fya ET, twabomfeshe inshila ya MS / MS iyapangwa kale. Iyi nshila ishintilila pa nshila ya kupanga ifilonganino fibili ku kubwesha ulupwa lwa fya kulya ukufuma ku fiputulwa fya MS / MS [icipe ca dot icalinga (NDP)] ne cipimo ca kupashanya icashintilila pa kuonaula kwabulamo ubusanso (NL). Iciputulwa ca mashiwi ya MS / MS icapangilwe ukupitila mu kupituluka mu mishilwa ya ET iya kwalula icapangilwe 585 MS / MS (ifailo lya mashiwi S1), icalungishiwe ukupitila mu kufibika mu fiputulwa cinelubali ifikulu ifya MS / MS (M) (Icilangililo 4A) . Ifi fiputulwa fimo fyalikwata ifya kulya ifingi ifyaishibikwa kale: ku ca kumwenako, M1, M2, M3, M4 na M7 fyalikwata ifya kulya ifingi ifyafuma ku fya kulya ifya misango yalekanalekana (M1), ifya kulya ifya kulya ifya kulya (M2), ifya kulya ifya kulya ifya kulya (M3 na M4), na 17-HGL-DTG (M7). Ukulundapo, amashiwi ayalungama aya fya kulya (Si index) aya fya kulya fimo muli cila ciputulwa yapendelwa, kabili ukusabankanya kwa iko ukwa Si kuti kwamonwa ukwabula ukupita mu mbali. Mukucefyako, imisango ya MS / MS iyalanga ifyakulya ifingi ifya miti ne misango ya fimenwa ifilangishiwa ne mibele ya Si iyakulisha, kabili imitantikile ya kurtosis ilangisha ukusabankanya kwa boya pa cifutu ca ku kulyo ica muci. Ukusabankanya kwa musango yo ukwa colloid kwasangilwe mu M1, umo phenol amide yalangishe iciputulwa ca Si icakulisha (Icikope 4B). Iciputulwa ca nshita icalumbulwa kale ica kulya ifya kulya ifya mpanga 17-HGL-DTG mu M7 calangishe amano ya Si ayalinga, ukulanga umusango walinga uwa mafunde ayapusana pakati ka misango ibili iya OS. Mukupusanako, ifingi ifyapangwa ifyakupanga ifyakupangapanga, pamo nga rutin, CGA, na shuga ya acyl, fyaba pa fipimo fya Si ifyacepako. Pakuti twishibe bwino bwino ubukata bwa mipangilwe no kwakanya kwa Si pakati ka fimenwa ifya pa lwakwe, umutande wa molekyulu walipangilwe kuli cila ciputulwa (Icikope 4B). Ukusobela kwacindama ukwa cisambilisho ca OD (icafushiwa mu cilangililo 1B) ca kuti ukubwekeshapo kwa fimenwa ifya pa lwakwe panuma ya kulya ifya kulya fya miti kulingile ukutwala ku kwaluka kwa nshila imo mu fimenwa ifyakwata umutengo wa kucingililwa, maka maka ukupitila mu kulundako ubupusano bwafiko (ukucila pa kusabankanya ukwabula ukwishiba) Umusango) Ifimenwa ifya pa lwakwe ifyasobelwe na MT theory. Iciputulwa cikalamba ica fipe fya phenol ifyalonganikwa mu M1 fyalikwata imilimo iyapalana no kuceepa kwa mibombele ya fipe (32). Ilyo twalinganya imitantikile ya Si mu fimenwa fya M1 pa kati ka mabuula ayatuntulu na mabuula ayapangwa aya fimenwa fya EV ifya kucenjela pa maawala 24, twamwene ukuti ukuilama kwa fimenwa ifingi pa numa ya fipe fya kulya ifya kulya fya mpanga kuli no kulunduluka kwakulisha (Icikope 4C). Ukuninina kwa mutengo wa Si kwasangilwe fye mu fipimo fya kucingilila, lelo takwali ukuninina kwa mutengo wa Si ukwasangilwe mu fipimo fimbi ifya phenols na ifintu ifishiishibikwe ifyasangwa pamo muli ici citabo. Iyi ni mibele iyaibela, iyapalana ne sambililo lya OD. Ukusobela kwakulisha ukwa kwaluka kwa fya kulya ifiletwa ne fya kulya ifya mpanga kulakonkana. Pa kwesha nga ca kuti uku kwaluka kwa musango wa phenolamide kwaletwa na OS-iyalinga ET, twapangile umusango wa Si uwa mubili kabili walengele ubupusano bwa kulanga umutengo pa kati ka OSM na OSS1 mu EV na sETR1 imisango ya fimenwa (Icikope 4D ). Mu sETR1, ubupusano bwaletwa ne fyakupangapanga pakati ka OSM na OSS1 bwacefiwe nga nshi. Inshila ya kupanga ifilonganino fibili na kabili yabomfiwe ku fyebo fya MS / MS ifyalonganikwe mu misango iyakwata JA iyalinga ukusondwelela ifiputulwa ifikulu ifya MS / MS ifikuma ku JA-ukukonkanyapo ukusambilisha kwa fya kulya (Icikope S6).
(A) Ifyasangwa mu kulonganika ifya 585 MS / MS ukushintilila pa ciputulwa icakanishiwa (ukupalana kwa NDP) no kuonaula kwakanishiwa ukwabulamo ubusanso (ukupalana kwa NL) ififumamo mu ciputulwa (M) ukuba icalinga no lupwa lwaishibikwa ulwa fibumba, nelyo ukupitila mu fibumba ifishaishibikwa nelyo ifishabomfiwa bwino. Pa mbali ya ciputulwa cimo na cimo, ukusabankanya kwa fimenwa (MS / MS) ukwalinga (Si) kulalangishiwa. (B) Inshila ya kupangamo ifipe: Amanode yaimininako MS / MS ne mipeto, NDP (umutuntulu) na NL (umutuntulu) amano ya MS / MS (ukuputulwa,> 0.6). Icilangililo ca misango ya fya kulya (Si) ica mabala ukulingana ne citabo (ku kulyo) kabili icalangishiwa ku mibombele ya molekyulu (ku kulyo). (C) Iciputulwa M1 ica cimenwa ca EV mu cifulo ca kupanga (ukukonkomesha) no kulenga (ukupashanya ifya kulya fya nama) pa maawala 24: icikope ca mibombele ya molekyulu (umutengo wa Si ni bukulu bwa node, ukucingilila phenolamide kwalangishiwa mu buluu). (D) Icilangililo ca M1 ica mulongo wa sETR1 ne mimwene ya EV na ET iyaonaika: umusango wa phenolic uwaimikwa ne cipimo ca cibulungwa ica katapa-katapa, no kupusana kwacindamisha (umutengo wa P) pakati ka W + OSM na W + OSS1 ukuposha nga ubukulu bwa cipimo. CP, N-kafeo-tirosini; CS, N-umuti wa kafe; FP, asidi wa N-umulopa uwa mulopa; FS, N-umusango wa ku mubili; CoP, N', N "-Ukubomfya kwa mubili; DCS, N', N"-Ukubomfya kwa Mubili; CFS, N', N"-kafeoyli, feruloyl-spermidine; Lycium barbarum mu Mwana wa mumbulu; Nick.
Twalikonkenyepo ukufwailisha ukufuma ku musango umo uwa Nepenthes uwacefiwa ukufika ku fipendo fya cifyalilwa, apo ukwaluka kwa maka ukwa mu kati ka fipimo fya JA ifya kulya ifya miti na ifipimo fya fimenwa ifya fimenwa fyalondolwelwe kale mu fipimo fya cifyalilwa (26). Bomfyeni iyi data iyabikwa pa kufimbapo amaplasma 43 aya fimenwa. Iyi misango ya fimenwa 123 ukufuma ku N. Ifi fimenwa fyafumine ku mbuto ishalonganikwe mu fifulo fyapusanapusana ifya cikaya mu Utah, Nevada, Arizona, na California (Icilangililo S7), twapende ubupusano bwa fya kulya (pano ubuleitwa umusango wa cipendo ca bantu) β ubupusano) no kusambilila ukwaletwa na OSM. Ukulingana na masambililo yapita, twamwene ukwaluka kwa misango yalekanalekana ukwa fya kulya mupepi na Hj na δj axes, ukulanga ukuti ama germplasms yalikwata ukupusana kwakulisha mu bupusano bwa fya kulya fyabo ifya kulya ku fya kulya fya mpanga (Icikope S7). Ici cilonganino cileibukisha ifya kumona kale pa lwa misango ya JAs iya kwaluka ukwaletwa ne fya kulya ifya mpanga, kabili lyasungile umutengo uukalamba nga nshi mu cipendo cimo (26, 36). Ukubomfya JA na JA-Ile ku kwesha ubupalamano bwa musango onse pakati ka Hj na δj, twasangile ukuti kuli ubupalamano ubusuma ubusuma pakati ka JA na ubupusano bwa β ubupusano no bucibusa bwa pa lwabo (Icilangililo S7). Ici cilelanga ukuti ubupusano ubuletwa ne fyakulya ifya miti mu JAs ukusangwa pa cipimo ca cipendo kuti bwaba pa mulandu wa misango yalekanalekana iya fya kulya ifiletwa no kusalapo ukufuma ku fya kulya ifya miti ikola.
Amasambililo ayapita yalangisha ukuti imisango ya fwaka yalipusana nga nshi mu misango no kushintilila pa kucingililwa kwa mubili. Casuminwa ukuti ifi fya kwaluka mu kwalula ifishibilo fya fyakulya ifya miti ikola na maka ya kucingililamo filatungululwa no kucincimusha kwa fipendo fya fimenwa, ubumi bwa fimenwa, na imitengo ya kucingililamo mu cifulo umo umusango umo ukulila. Twasambilile pa lwa kwalula kwa mabuula ukwaletwa na nama sha misango mutanda isha Nicotiana isha ku America wa ku Kabanga na ku Masamba ya America. Iyi misango ya nama iyapalana sana na Nepenthes iya ku North America, ekutiila Nicolas Bociflo. La, N. amafuta ya kunwa, amafuta ya kunwa n. ifyuni ifyacefiwa, ifya kulya fya mu mpanga, ifya kulya fya musango umo, ifya kulya fya musango yo (Icikope 5A) (37). Imisango 6 pali iyi, ukubikapo ne misango iyaishibikwa bwino iya N. mukwai, ni miti iya mwaka iya petunia, na amabuula ya petunia N. ni miti iya muyayaya iya mutundu wa nkashi Trigonophyllae (38). Pa numa, W + W, W + OSM na W + OSS1 ukubikwamo kwacitilwe pali ifi fimenwa cinelubali ku kusambilila imisango ya fimenwa iya kupanga cipya cipya ifya kulya fya fipe.
(A) Umuti wa cifyalilwa uwashintilila pa kufikapo kwakulisha [ukupanga umukaka wa nyukiliya (38)] no kwakanishiwa kwa fifulo cinelubali ukwa misango ya Nicotiana iyapalana sana (amabala yalekanalekana) (37). (B) Iciputulwa ca kusansalikwa ica misango yalekanalekana iya misango cinelubali iya Nicotiana (939 MS / MS; failo ya fyebo S1). Pa mulingo wa misango, ukwaluka kwa fya kulya fya mubili takwapalana bwino bwino ne cipimo ca kusambilila. Ukufwailisha kwa misango ya fimenwa iyapalana pakati ka misango yalekanalekana iya fyakulya no kusambilila no kulonganika kwa JA kulangililwa mu cilangililo 2. S9. Ilangi, imisango yalekanalekana; amabokoshi yatatu, W + OSS1; iciputulwa ca nshita, W + OSM; (C) Ukucincimusha kwa Nicotiana JA na JA-Ile kwabikwa ukulingana no kucincimusha kwa OS (ANOVA ya nshila shibili na Tukey HSD pa numa ya kulinganya kwafulilako, * P <0.05, ** P <0.01 na * ** Pa kulinganya kwa W + OS na W + W, P <0.001). Icilangililo ca kabokoshi ica (D) ukwaluka na (E) ukusambilila kwa cila musango panuma ya kwesha ifyakulya ifya miti na methyl JA (MeJA). Icilangililo cilanga ubupusano ubukalamba pakati ka W + OS na W + W nangu lanolin ukubikako na W (Lan + W) nangu Lan ukubikako na MeJA (Lan + MeJa) na Lan ukukonka (ukupitulukamo mu nshila shibili ukwa kwaluka, ukukonkwapo na Tukey's HSD pa numa ya kulinganya kwafulilako , * P <0.05, ** P <0.01 na 1).
Ukubomfya inshila ya filonganino fibili, twaishibe ifiputulwa 9 ifya 939 MS / MS (ifailo lya fishinka S1). Ukupanga kwa MS / MS ukwapangwa cipya cipya ku miti yalekanalekana kulapusana nga nshi pa kati ka fiputulwa fyalekanalekana pa kati ka misango (Icikope S8). Ukumona Hj (iyalumbulwa pano nga umusango wa fimenwa γ-ukwapusana) na δj ilasokolola ukuti imisango yalekanalekana ilalongana mu mabumba ayapusana nga nshi mu cifulo ca fyakulya, apo ukwakanishiwa kwa misango ya fimenwa ilingi line kulamoneka ukucila ukucincimusha. Ukufumyako fye N. umutande na N. umutande, balalanga imisango iikalamba iya fifumamo fya kutendekelako (Icikope 5B). Mukupusanako, imisango pamo nga N. purpurea na N. obtusifolia tayakwata ifyasuko ifinono ifyakubomfya ku kundapa, lelo ifyakubomfya ifyakulya fyalipusana. Ukwakanya kwa misango yalekanalekana ukwa kwasuka kwa fya kulya ukwalengele ukuti kube ubupalamano ububi pakati ka kusambilila no kwaluka kwa gamma (PCC = -0.46, P = 4.9 × 10-8). Ukupilibuka kwaletwa na OS mu fipimo fya JAs kwapalana bwino bwino no kusambilila kwa fya kulya, kabili kwapalana ububi no kwaluka kwa fya kulya ukwa gamma ukwalangishiwa na cila musango (Icikope 5B na Icikope S9). Calicindama ukwishiba ukuti imisango ya fimenwa iyalumbulwa mu citundu ca “cishibilo ca kwasuka” mu cilangililo 5C, pamo nga ifimenwa fya mu nkumbabulili, ifimenwa fya nkumbabulili, ifimenwa fya nkumbabulili ifya nkumbabulili, ne nkumbabulili iyacepa, fyalengele ifishibilo fyacindama pa maminiti 30. Ukubutuka kwa nomba line ukwa JA na JA-Ile ukwa OS, lintu utushishi tumbi utwaitwa “icilangililo icabula ukwasuka”, pamo nga ifipe fya kupangapo ifya kulya, ifya kulya fya kupangapo ifya kupangapo ifya kupangapo ifya kupangapo ifya kupangapo ifya kupangapo ifya kupangapo ifya kulya ifya JA-Ile Edge ukwabula ukusangwako kwa OS (Icikope 5C). Pa mulingo wa fya kulya, nga fintu tulandilepo pa muulu, ku Nepenthes uwacefiwa, ifintu ifyasuko ku cishibilo fyalangile OS ukuibela no kulundulula nga nshi δj, lintu ukucefyako Hj. Ici OS-icaibela ica kutendekelako tacasangilwe mu misango iyatantikwa nge cishibilo ca misango iishibomba (Icilangililo 5, D na E). Ama metabolite ayapusanapusana aya OS yapeelwa ilingi line pakati ka misango iyasuka ifishibilo, kabili ifi fibumba fya fishibilo filalongana ne misango iyakwata ifishibilo ifinono, lintu imisango iyakwata ifishibilo ifinono ilalanga ukushintilila ukucepa (Icilangililo S8 ). Ici cifumamo cilanga ukuti ukubikwamo kwa OS ukwa JAs no kwalula kwa OS ukwa metabolome iya ku nse ya menshi fyabikwa pamo pa mulingo wa misango.
Pa numa, twabomfeshe umukaka wa lanolin uwakwata methyl JA (MeJA) ku kundapa ifimenwa ku kufwailisha nga ca kuti iyi misango ya kupanga ifimenwa yalikanishiwa ku kubapo kwa JA iyabomfiwa na JA iya ku nse, iyo ikabe mu fimenwa. Ukufumyapo bwangu bwangu ni JA. Twasangile umusango umo wine uwa kwaluka panono panono ukufuma ku misango ya fishibilo-iyasuka ukufika ku fishibilo-ifishasuminisha ifiletwa no kutwalilila ukupeelwa kwa JA (Icikope 5, D na E). Mukucefyako, ukundapa kwa MeJA kwabwekeshepo ukupanga ifyakupangapanga ifya misango misango, N. N. umutuntulu walangishe fye ukulundako kwa δj, lelo te Hj. N. obtusifolia, iyo kale yalangishiwe ukulonganika ifipimo ifinono nga nshi ifya JAs, na yo ilasuka bwino ku kundapa kwa MeJA mu milandu ya kupanga cipya cipya ifya kulya. Ifi fyasangwa filangilila ukuti ukupanga kwa JA nangu ukupilibula kwa cishibilo kwakanishiwa mu misango ya fishibilo ifishasuka. Pa kwesha uku kutontonkanya, twasambilile imisango ine (N. amabuula, N. ifipe, N. amabuula ayafiita na N. amabuula ayanono) ayaletwa na W + W, W + OSMs na W + OSS1 Ukulemba (39). Ukulingana ne mibele ya kupanga cipya cipya, imisango ya fimenwa yalipaatukana bwino mu cifulo ca fimenwa, pakati ka iyo N. iyacefiwa yalangishe RDPI iyakulisha iya OS, lintu N. iyacefiwa yali ne yacepako (Icilangililo 6A). Na lyo line, casangilwe ukuti ubupusano bwa fimenwa ifyalembwa na N. oblonga bwali ubunono pa misango ine, ukupusanako no bupusano bwa fimenwa ifya N. oblonga ubwalangishiwe kale mu misango cinelubali. Amasambililo yapita yalangisha ukuti ibumba lya fimenwa ifikuma ku fishibilo fya kucingililwa ifya kubalilapo, ukubikapo ne fishibilo fya JA, filondolola ubutuntulu bwa fyasuko fya kucingililwa ifya kubalilapo ifiletwa na balya ifya kulya ifya mpanga mu misango ya Nicotiana (39). Ukulinganisha inshila sha kulangamo JA pakati ka ifi fimenwa fine kwasokolwele umusango uwa kusekesha (Icikope 6B). Iciputulwa cikalamba ica fimenwa muli iyi nshila, nga AOC, OPR3, ACX na COI1, fyalangile imisango iikalamba iya kutendekelako muli ifi ifimenwa fine. Nalyo line, umusango ukalamba uwa cishilano, JAR4, ulapilibula JA mu musango wakwe uwa JA-Ile uwabikwa pamo, kabili umusango wakwe uwalembwa walicepa nga nshi, maka maka mu N. Ukulundapo, fye ifyalembwa ifya cishibilo cimbi ica AOS tafyasangilwe mu N. Uku kwaluka mu mimonekele ya fimenwa kuti kwalenga imisango ya fimenwa iyakulisha iyaletwa na ukupanga kwa JA ukwacepa mu misango ya fimenwa ifishakwata amaka no kuleta kwa N. gracilis.
(A) Ukufwailisha kwa mashiwi ayalanda pa kwalula amasuko ya kubalilapo aya misango ine iya fwaka iyapalana sana iyasangilwe amaminiti 30 panuma ya kutendekelako ifya kulya ifya miti. RDPI ipendwa ukupitila mu kulinganya amabuula ayaletwa na OS iya kulya ifya kulya ifya mpanga no kucefyako ifilonda. Amalangi yalalanga imisango yalekanalekana, kabili ifishibilo filalanga inshila shalekanalekana isha kundapilamo. (B) Ukupitulukamo mu mimonekele ya fimenwa mu nshila sha kulanga JA pakati ka misango ine. Inshila ya JA iyayanguka ilangishiwa mupepi ne cipao ca kabokoshi. Amalangi ayapusanapusana yalalanga inshila shapusanapusana isha kubomfya. Icilangililo cilanga ukuti kuli ukupusana kwakulisha pa kati ka kundapa kwa W + OS no kucenjela kwa W + W (ku t-test ya Musambi pa lwa kupusana kwa babili babili, * P <0.05, ** P <0.01 na *** P <0.001). OPDA, asidi wa fimenwa ifya 12; OPC-8: 0,3-oxo-2 (2'(Z)-acindami-1-acindami.
Mu ciputulwa ca kulekelesha, twasambilile ifyo imisango ya fimenwa iyapusanapusana iya fimenwa kuti yashipikisha ifya kulya ifya miti. Ukufwailisha kwa pa numa kwakomaila pa musango wa Nicotiana. Ukulwisha kwabo kuli Ms na ku nshishi kwalipusana nga nshi (40). Apa, twasambilile ubupalamano pakati ka iyi mibele na ubupusano bwabo ubwa fyakulya. Ukubomfya imisango ine iya fwaka iyalumbulwa pa muulu, no kwesha ubupalamano pakati ka misango yalekanalekana no kusambilila kwa metabolome ukwaletwa na balya ifya kulya ifya miti no kukana kwa fimenwa kuli Ms na Sl, twasangile ukukansana, ukulekanalekana no kusambilila ku basambi bonse Sl Bonse bali no bupalamano ubusuma, lintu ubupalamano pakati ka kukansana ku basambilila abanakashi te, na Fig na ( I10). Ukukuma ku kukansana kwa S1, fyonse fibili ifyacefiwako N. chinensis na N. gracilis, ifyo fyalangishiwe kale ukulanga fyonse fibili ifishibilo fya JA ifyakupilibula imilingo na ubupusano bwa fyakulya, fyalikwete amasuko ayapusana nga nshi ku kutwala ifya kulya ifya miti, kabili nafyo fyalangile ukukansana ukwakulisha ukwapalana. Ukulalana.
Mu myaka amakumi mutanda iyapitapo, isambililo lya kucingilila ifimenwa lyalipeela umusango wa fimenwa, ukushintilila pali ifyo abafwailisha basobele impendwa iikalamba iya kwaluka ne milimo ya fimenwa ifyaibela. Iciputulwa cikalamba ica ifi ifisambilisho tafikonka inshila iyalinga iya fishinka fya maka (41). Bapeela ifyakusobela ifikankaala (3) pa mulingo umo wine uwakupitulukamo. Ilyo ukufwailisha kwa fishinka fikalamba ifya kusesema kwasuminisha amasambililo ayalinga ukupitulwikwamo, ici cikalenga umulimo ukuya ku ntanshi. Ukutungililwa, lelo ukukaana bambi (42). Mucifulo ca ico, isambililo lipya lipanga ukusobela pa fipimo fyapusanapusana ifya kupitulukamo no kulundapo umusango upya uwa fishinka fya kulondolola (42). Nalyo line, amasambililo yabili ayapeelwe pa mulingo wa mibombele, MT na OD, kuti yalondolwelwa bwangu nga ukusobela kwacindama ukwa kwaluka kwa fya kulya ukwa pa lwakwe ukwaletwa na fya kulya ifya mpanga: isambililo lya OD lisumina ukuti ukwaluka mu fya kulya ifya pa lwakwe “icifulo” kuli ukwalungama nga nshi . Icisambililo ca MT cisumina ukuti ifi fya kwaluka tafyakwata ubutungulushi kabili fikasangwa mu cifulo ca fyakulya, kabili kuti fyakwata ifyakulya ifyacindama ifyakucingilila. Ukufwailisha kwa pa numa ukwa OD na MT ukusobela kwalyeselwe ukubomfya umutande uunono uwa priori “ukucingilila” amakompawundi. Aya amakwebo ayashintilila pa fya kulya ifipya yalesuminisha amaka ya kupituluka mu bukulu bwa fya kulya ifipya mu nshita ya kulya ifya kulya ifya mpanga, kabili tayasuminisha ukufwailisha mu kati ka mitantikile iyalinga iya kufwaya ukusobela kwacindami ukwa kuti kuti kwamonwa nga ukupenda ukwaluka kwa fya kulya ifipya mu fimenwa. Apa, twabomfeshe ubuteko ubupya mu fyakupangapanga ifyashintilila pa MS iya kompyuta no kucita ukupitulukamo kwa MS mu ndalama shakulisha isha mashiwi ayalondolola ifyakupangapanga pakwesha ubupusano pakati ka ifi fibili ifyapeelwe pa mulingo wa fyakupangapanga ifya calo conse. Ukusobela kwacindami ukwa ili isambililo. Amashiwi yasambilishiwa yalibomfiwa mu fifulo ifingi, maka maka mu milandu ya fimenwa ne fyakulya ifingi ifya kufwailisha (43). Na lyo line, ukulingana na fintu twaishiba, uku e kubomfya kwa kubalilapo ukubomfiwa ku kulondolola amashiwi ya fya kulya aya mu fimenwa no kupwisha amafya ya fimenwa ayapalana no kwaluka kwa fya kulya ukwa pa kashita akanono mu kwasuka ifishibilo fya mu ncende. Mucaice, amaka ya iyi nshila yaba mu maka ya iko aya kulinganya imisango mukati na pakati ka misango ya fimenwa pakuti bamone ifyo ifilya ifya kulya fya miti fyafumine ku misango yalekanalekana ukufika ku misango yalekanalekana iya misango pa fipimo fya misango yalekanalekana. Ukupilibula ifyakulya.
Ukufwailisha kwa fiputulwa ifikulu (PCA) kwalula amashiwi ayapusanapusana mu cifulo ca kucefyako ubukulu pakuti umusango ukalamba uwa mashiwi wingalondolwelwa, kanshi ilingi line ilabomfiwa nge nshila iya kufwailishishamo ukupitulukamo mu mashiwi, pamo nga ukuwamya kwa fishinka. Na lyo line, ukucefyako ubukulu kukaonaula iciputulwa ca mashiwi ayasangwa mu fipekanyo fya mashiwi, kabili PCA tekuti ipeele amashiwi ayalinga pa mibele iyalinga nga nshi ku masambililo ya fya mweo, nga: ifyo ifyakulya ifya miti fipanga cipya cipya ubupusano mu fifulo fyaibela (ku cakumwenako, ubunonshi, ukwakanya) no buvule) ifya kulya? Ni finshi ifipilibula ifya kulya ifilanga imibele ya cilya ica kulya ica mpanga? Ukufuma ku mimwene ya misango yalekanalekana, iyapusana no kukanakonkapo, amashiwi ayasangwa mu misango ya fyakulya ifya misango yalekanalekana iya mabuula yaonaika, kabili cisangwa ukuti ukulya ifyakulya ifya miti kuti kwalenga ifyakulya ifya misango yalekanalekana ukubomba. Mu kukanacetekela, twamwene ukuti, nga fintu calondolwelwe mu filangililo fya mashiwi ayabomfiwa, imibele ya fya kulya iyafumamo yalikwata ukucilapo ukukalamba pa numa ya kusansalikwa kwa fibumbwa fibili ifya kulya ifya kulya (umusambi wa fya kulya fya bushiku Sl) na kasambilisha wa Solanaceae Ms. Amafuta ya asidi-asidi ya amino (FAC) iyatendeka mu OS (31). Ukubomfya OS iya fya kulya fya nama ku kundapa ifilonda fya kupanga ifyalinga, ukundapa kwa fya kulya fya nama ukwapalana na ko kwalangile umusango umo wine. Iyi nshila iyalinga iya kulinganya ifyasuko fya fimenwa ku kusansalikwa kwa fimenwa ifilya ifya kulya fya mpanga ilafumyapo ifintu ifilenga ukukansana ifiletwa no kwaluka mu mibele ya kulya iya fya kulya fya mpanga, ifitwala ku misango yalekanalekana iya konaula pa nshita shapusanapusana (34). FAC, iyo yaishibikwa ukuti e mulandu ukalamba uwa OSM, ilacefyako JAS na fimbi ifyasuko fya mahomoni ya fimenwa mu OSS1, lintu OSS1 ilacefyako imiku amakumi yabili (31). Nangu cibe fyo, OSS1 yalengele imilingo iyapalana iya kulonganika kwa JA ukulingana na OSM. Calangishiwe kale ukuti ukwasuka kwa JA mu Nepenthes uwacefiwa kwalicindama nga nshi ku OSM, uko FAC kuti yasunga umulimo wa iko nangu ca kuti yasansalikwa 1:1000 na menshi (44). E ico, ukulingana ne OSM, nangu ca kuti FAC mu OSS1 yalicepa nga nshi, yalifikapo ukulenga ukubutuka kwa JA ukwalinga. Amasambililo ayapita yalangisha ukuti amaproteini ayapalana na porin (45) na amafuta ayanono (46) kuti yabomfiwa nga ifilangililo fya molekyulu ku kulenga ifimenwa ukucingililwa mu OSS1. Nangu cibe fyo, taciishibikwe nga ca kuti aba ba elicitors mu OSS1 e balenga ukulonganika kwa JA ukwamonwa mu kufwailisha kwa nomba.
Nangu cakuti kuli amasambililo ayanono ayalondolola imisango ya minwe iyapusana iya fyakulya ifiletwa no kubomfya kwa fyakulya ifya misango yalekanalekana nangu JA nangu SA (salicylic acid) (47), tapali uwasakamika imisango ya fyakulya ifya misango yalekanalekana mu misango ya fyakulya ifya miti ne fyo ififumamo mu fyakulya ifya misango yalekanalekana. amashiwi ya pa lwakwe. Uku kufwailisha kwashininkishe na kabili ukuti ukusuntinkana kwa mahomoni ya mukati na mahomoni ya fimenwa fimbi ukucila pali JAs kwapanga ubutuntulu bwa kupanga cipya cipya ukwa fya kulya ifiletwa na balya ifya kulya ifya miti. Mu kupalako, twasangile ukuti ET iyaletwa na OSM yali iyakulisha ukucila iyo iyaletwa na OSS1. Iyi mibele ilakonkana ne fingi ifya FAC mu OSM, ifyo fyakabilwa kabili ifyalinga ifya kulenga ET ukubutuka (48). Mu milandu ya kwampana pakati ka fimenwa na ifilya ifya kulya ifya miti, umulimo wa kulanga uwa ET pa misango ya fimenwa iyapusanapusana ucili uwapusanapusana kabili uletungilila fye ibumba limo ilya fimenwa. Ukulundapo, amasambililo ayengi yabomfya ukubomfya kwa ET ukwa kunse nangu ifikonkelepo fya iko nangu ifishinte fyapusanapusana ku kusambilila amafunde ya ET, pakati ka ifi ifibombelo fya kemikali ifya kunse fikapanga ifilubo ifingi ifishaishibikwa. Ku kwishiba kwesu, ili isambililo limininako ukufwailisha kwakubalilapo ukwakulisha ukwa mulimo wa ET mu kubomfya kwa ET ku kupanga no kwishiba ifimenwa ifyaonaika ifyakupangapanga pakuti filungike imibombele ya fimenwa. Ukubikwamo kwa ET ukwa balya ifya kulya ifya miti kuti pa numa kwalula ukwasuka kwa fya kulya ifya mubili. Icacindama sana ni ukubomfya kwa fimenwa ifya ET (ACO) no kumfwikisha (ETR1) ifimenwa ifyasokolwele ukulonganika kwa fimenwa ifya kulya ifya kulya ifya mpanga. Calangishiwe kale ukuti ET kuti yalungika bwino ukulonganika kwa nicotine ukwaletwa na JA ukupitila mu kutungulula ukulonganika kwa nicotine ukwaletwa na JA (49). Na lyo line, ukufuma ku mimwene ya makanika, tacishibikwe bwino bwino ifyo ET ilungamika ukubikwamo kwa phenamide. Ukulunda pa mulimo wa kupilibula ifishibilo fya ET, ukupita kwa fya kulya kuti kwasuntinkanishiwa ku S-adenosyl-1-methionine ku kusunga ukubika indalama mu fya kulya ifya polyaminophenol. S-adenosyl-1-methionine ni ET kabili iyalinga iya pakati ka nshila iya kupangamo ifya kulya ifya mweo. Inshila iyo icishibilo ca ET citungulula umusango wa phenolamide ilekabila ukusambililwa nafimbi.
Pa nshita itali, pa mulandu wa mpendwa iikalamba iya fimenwa ifishaishibikwa, ukubika amano ku fiputulwa fya fimenwa ifyapusanapusana takwakwanishe ukupima ukwaluka kwa nshita ukwa misango yalekanalekana iya fimenwa panuma ya mibombele ya fimenwa. Pali ino nshita, ukushintilila pa kufwailisha kwa mashiwi, icafumamo cikalamba ica MS/MS ukusanga imisango ya fimenwa ukushintilila pa fya kulya ifishakwata ulubali ni co ifya kulya ifya kulya nelyo ukupashanya ifya kulya fya fya kulya filatwalilila ukucefyako imisango yonse iya fya kulya ifya mabula ilyo filekulisha umusango wa fya kulya fya iko ifya pa lwabo. Uku ukulundako kwa pa kashita akanono ukwa misango ya fimenwa ifiletwa na balya ifya kulya fya nama kwapalana no kulunduluka kwa mibombele ya fimenwa. Icintu icilenga sana ukusambilila ifya kulya ifikulu (ukukwata umutengo uukalamba uwa Si) ni cilya icaibela icakwata imilimo ya kulya ifya kulya ifya mpanga. Iyi mibele ilakonkana no kusobela kwa OD, lelo ukusobela kwa MT ukukuma ku kukanaishiba kwa metabolome ukwa kupanga cipya cipya takukonkana. Na lyo line, ifi ifishinka nafyo filekonkana no kusesema kwa misango yasankanishiwa (MT iisuma; Icikope 1B), pantu fimbi ifishaishibikwa ifyakwata imilimo ya kucingililwa kuti fyakonka ukwakanishiwa kwa Si ukwabula ukwishiba.
Icilangililo icaishibikwa icakonkwapo ukusangwa muli uku kufwailisha ca kuti ukufuma ku cipimo ca kwaluka kwa fimenwa ifinono (icimenwa cimo na cipendo ca fwaka) ukufika ku cipimo cikalamba ica kwaluka (imisango ya fwaka iyapalana), ifipimo fyapusanapusana ifya kwaluka kwa filonganino fyaba mu “kucingililwa ukusuma” Kuli ukupusana ukwacindamisha mu maka ya fimenwa ifya kulya ifya miti. Moore na bambi. (20) na Kessler na Kalske (1) mu kuitemenwa bapingwilepo ukupilibula imilingo itatu iya mulimo iya misango yalekanalekana iya fya mweo iyapusanapusana pa kutendeka na Whittaker (50) mu kwaluka kwa nshita ukwa misango yalekanalekana iya kemikali; aba balembele tabafushishe Inshila sha kulonganikamo ifyebo ifingi ifya metabolome na kabili tashilondolola ifyo twingapenda ukulekanalekana kwa fya kulya ukufuma muli ifi fishinka. Muli ili isambililo, ukuwamya ukunono ku kwakanya kwa mibombele ya Whittaker kukamona α-ukwaluka kwa fyakulya nga ukwapusana kwa misango ya MS/MS mu cimenwa cimo, na β-ukwakana kwa fyakulya nga ubupusano bwa misango ya fimenwa ifya cibumba ca bantu Umuputule, na γ-ukwaluka kwa fyakulya kukaba ukwalundwako kwa misango iyapalana.
Icilangililo ca JA cikankala ku fyasuko ifingi ifya fyakulya ifya miti. Na lyo line, tapali ukufwailisha kwakulisha ukwa kwafwilisha kwa mafunde ya JA aya mipangilwe ya fimenwa ku misango yalekanalekana iya fya kulya, kabili nga cakuti icilangililo ca JA ni ncende iyalinga iya misango yalekanalekana iya fya kulya ifiletwa no kusakamana pa cipimo cakulisha ica kwaluka kwa fimenwa na nomba line tacaishibikwa. Twamwene ukuti ubutuntulu bwa fyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya ifyakulya no kwaluka kwa misango ya fyakulya ifyakulya mu cipendo ca misango ya Nicotiana na pakati ka misango ya Nicotiana iyapalana sana ifipaleneko bwino bwino ne fishibilo fya JA. Ukulundapo, ilyo icilangililo ca JA caonaika, ukuilama kwa fya kulya ukwaletwa ne cimenwa cimo ica kulya ifya kulya fya mubili kukafumiishiwapo (Icikope 3, C na E). Ukutula apo ukwaluka kwa misango ya fyakulya ifya Nepenthes ifyacefiwako kwaba ukwalinga, ukwaluka mu misango ya fyakulya β ukwapusanapusana no kulungatika muli uku kupituluka kuti kwaletwa sana no kucincimusha kwa maka ukwa misango ya fyakulya ifyakwata ifyakulya ifingi. Aya amabumba ya filonganino yacilapo pa ciputulwa ca mibele ya fya kulya kabili yatwala ku bwampano ubusuma ne fishibilo fya JA.
Pa mulandu wa kuti imibombele ya fya mweo iya misango ya fwaka iyapalana na yo yalipusana nga nshi, ifintu ififuma mu mubili fyaishibikwa bwino bwino mu lubali lwa mibele isuma, eico calicindama ukupitulukamo. Amashiwi ayabomfiwa pa lwa mibele ya fyakulya ifikwatwa yasokolola ukuti ukubikwamo kwa fyakulya ifya miti kulakulisha ukukansana pakati ka misango ya fyakulya ifya gamma no kusambilila. Icilangililo ca JA cilabomba umulimo ukalamba muli uku kukansana. Ukuninina kwa mipangilwe ya fya kulya kulakonkana no kusesema kwa OD kabili kwapalana bwino ne cishibilo ca JA, elyo icilangililo ca JA cilaumfwana ububi ne misango ya fya kulya ifya gamma. Iyi misango ilangisha ukuti amaka ya OD aya fimenwa yashintilila sana pa bupusano bwa JA, nangu pa cipimo ca kwaluka ukwacepa nangu pa cipimo ca kwaluka ukwakulisha. Amakwebo ya kubomfya JA ayafuma kunse ayacingilila ifilubo fya JA ifyakupangapanga ifya mweo fyasokolola ukuti imisango ya fwaka iyapalana kuti yapusana mu misango iyasuka ku fishibilo na iishasuka ku fishibilo, nga filya fine imisango yabo iya JA na ubupusano bwa metabolome ubuletwa na balya ifya kulya ifya miti. Imisango ya fishibilo ifishasuka tekuti yasuke pa mulandu wa kukanakwata amaka ya kupanga JA iya mukati kabili kanshi kuti yakwata ifipimo fya mubili. Ici kuti caletwa no kwaluka mu fimenwa fimo ifikankaala mu nshila ya JA iya kulanga (AOS na JAR4 mu N. Ici cifumamo cilanga ukuti ifi ifimenwa ifya misango yalekanalekana kuti fyatungulwilwa sana no kwaluka mu mimwene ya mahomoni aya mukati no kwasuka.
Ukulunda pa kwampana pakati ka fimenwa na ifilya ifya kulya ifya miti, ukufwailisha kwa misango yalekanalekana iya fyakulya fya mubili kwapalana na fyonse ifikankaala ifyakutwala pa ntanshi mu kufwailisha pa lwa kwampana kwa fimenwa ne fyakupangapanga ne fyakupangapanga ifya misango yalekanalekana. Pa mulandu wa kulunduluka kwa fishinka ifisangilwe ku fibombelo fya nomba line ifya MS, ukufwailisha kwa mimwene pa lwa misango yalekanalekana iya fya kulya nomba kuti kwacila pa kwaluka kwa fya kulya ifya muntu umo umo / umusango wa fya kulya no kucita ukufwailisha kwa calo conse ku kusokolola imibele iishicetekelweko. Mu nshita ya kufwailisha ukwakulisha, icilangililo icacindama ni ntontonkanya ya kupanga amapu ayacindama aya kuti yabomfiwa ku kufwailisha amashiwi. Eico, icafumamo icacindama ica nomba line ica kusakanishiwa kwa MS/MS ukwabula ulubali na masambililo ya mashiwi ni cilya cipeela ubupiina ubunono ubwa kuti kuti bwabomfiwa ku kupanga amapu ku kufwailisha imisango yalekanalekana iya fya kulya pa fipimo fya misango yalekanalekana. Ni cishinka ca kubalilapo ica iyi nshila. Isambililo lya kwaluka kwa fipimo ifinono/ifikulu na imikalile ya cikaya.
Pa mulingo wa kwaluka kwa fimenwa ifikulu, umulandu wa kwaluka kwa fimenwa ne fikoko ifya Ehrlich na Raven (51) ni ukusobela ukuti ukwaluka kwa misango yalekanalekana iya fimenwa ecilenga ukwaluka kwa misango ya fimenwa. Nangu cibe fyo, mu myaka amakumi yasano ukufuma apo uyu mulimo wa mbuto walembelwe, uku kutontonkanya takwakweshiwe sana (52). Ici cicitika sana pa mulandu wa mibele ya fimenwa iyapalana ne mibele ya fyakulya iyapalana mu mitundu ya fimenwa ifyakutali. Ukucepa kuti kwabomfiwa ku kusunga inshila sha kufwailishishamo ifishinka. Iciputulwa ca nomba ica MS / MS ica mulimo icabomfiwa ku cisambilisho ca mashiwi cipima ukupalana kwa mipangilwe ya MS / MS iya fimenwa ifishaishibikwa (ukwabula ukusalapo kwa fimenwa ifishaishibikwa) kabili cipilibula ifi MS / MSs mu cilonganino ca MS / MS, eico mu fya kulya fya basambilila Ifi ifilangililo fya kwaluka kwakulisha filalinganishiwa mu cipimo ca kwakanya. Ifilangililo fya mipendelo ifyanguka. Ici citabo cipalene no kufwailisha kwa fimenwa, ifingabomfya ukukonkana kwa fimenwa pa kupima ubukulu bwa misango yalekanalekana nangu ukwaluka kwa mibele ukwabula ukusobela.
Pa mulingo wa fya mweo, ukufwailisha kwa Firn na Jones (53) kulangilila ukuti ukwaluka kwa fya kulya kulasungwa pa fifulo ifyapusanapusana pa kupeela ifya kulya ifibomfiwa ku kubomfya imilimo ya fya mweo ifya kale ifyabula ubupalamano nelyo ifyabikwa mu cifulo ca fya kulya. Inshila sha masambililo ya mashiwi shipeela umusango umo ifi ifipilibulwa ifya misango misango ificitika mu nshita ya kusambilila kwa misango kuti fyapimikwa nge ciputulwa ca mibombele ya kufwailisha iya kwaluka: ukuwamya kwa mibombele ya bumi ukufuma ku misango yacepa ukufika ku misango iikalamba iya misango ya misango iyakanishiwa iya cifulo cimo.
Mukulonganika fyonse, mu nshiku sha kubalilapo isha fya mweo ifya molekyulu, amasambililo ayacindama aya kucingilila ifimenwa yapangilwe, kabili inshila sha kusondwelelamo ishimonwa nge nshila fye imo iya kulunduluka kwa sayansi. Ici cicitika sana pa mulandu wa kucefyako kwa mibombele ya kupima umubili onse uwa mubili. Nangu cakuti inshila ishitungululwa ne mimwene shalicindama nga nshi mu kusala inshila shimbi ishalenga, amaka yabo aya kutungilila ukwishiba kwesu ukwa mibombele ya fya mweo yalicepa ukucila inshila sha kompyuta ishisangwa nomba muli sayansi iyakwata amashiwi ayengi aya nomba. Eico, amasambililo ayashingasobelwa yali ukutali ukucila pa cipimo ca fishinka ifisangwa, eico umusango wa kutontonkanyapo / ukufwailisha kwa muputule wa kutunguluka mu ciputulwa ca kufwailisha te kuti kufumishiwepo (4). Tumona ukuti imibombele ya kompyuta iya mipangilwe ya fyakulya iyalembwa pano kuti yabwekeshapo ukufwaisha mu milandu ya nombaline (ifyo) na iyakulekelesha (mulandu nshi) iya misango yalekanalekana iya fyakulya, no kwafwilisha inshita ipya iya sayansi iyatungululwa na masambililo. Inshita yapitulwikemo na kabili mu fisambililo fyacindama ifyalengele inkulo shapita.
Ukuliisha kwa fimenwa ukwalungatana kulacitwa ukupitila mu kukusha akacece ka cibili nangu akacece ka Sl pa buula limo ilya cimenwa ica mabala ayafiita ica cimenwa cimo ica maluba ya rose, ne fimenwa 10 ifyapalanako pa cimenwa cimo. Ifipe fya nshishi fyalipooselwe ku fipe, kabili umubili wa mabula uwashele walilonganikwe pa numa ya maawala 24 na 72 pa numa ya kukwata ubulwele no kufimba bwangu, kabili ifya kulya fyalefumishiwapo.
Ukupashanya ukundapa kwa fya kulya ifya miti mu nshila iyalinga nga nshi. Inshila ya kubomfya amapili ya misango ya nsalu ku kubomfya imilongo itatu iya myunga ku lubali lumo na lumo ulwa mu kati ka mabula yatatu ayasansalikwa bwino bwino aya cimenwa mu nshita ya kukula kwa cimuti ca nsalu, kabili apo pene ukubomfya 1:5 Diluted Ms. Ukuseepa no kupanga ibuula nga fintu calondolwelwe pa muulu. Ukubomfya inshila yalondolwelwe kale ku kufumyapo ifya kulya fya kubalilapo ne fimenwa (54).
Pa kubomfya kwa JA ukwa ku nse, amabuula yatatu aya cila cimo ica fimenwa fya rose 6 ifya musango umo umo fyabomfiwa na 20 μl iya musambo wa lanolin uwakwata 150 μg MeJA (Lan + MeJA), na 20 μl iya lanolin pamo no kucingililwa ku filonda (Lan + W), nelyo ukubomfya pur. Amabuula yasontelwe ama-awala 72 panuma ya kubomfya, ukubikwa mu menshi ya nitrogen, no kusungwa pa -80°C ukufika ilyo yabomfiwa.
Imisango ine iya JA na ET iya kwalula, e kutila irAOC (36), irCO1 (55), irACO na sETR1 (48), yalisangwa mwi bumba lyesu ilya kufwailisha. irAOC yalangishe nga nshi ukucepa kwa JA na JA-Ile, lintu irCOI1 tayali iyaumfwika ku JAs. Ukulingana na EV, ukulonganika kwa JA-Ile kwalikulile. Mu nzila imo ine, irACO ikacefyako ukupanga ET, kabili ukulingana na EV, sETR1, iyo iishikwata amaka ya ET, ikakulisha ukupanga ET.
Icipimilo ca laser icakupiminako (Icipimilo ca ETD-300 icakupiminako ica nshita iine-ine iya ET) cibomfiwa ku kucita ukupima kwa ET ukwabula ukubikako amano. Ilyo line fye pa numa ya kuundapa, iciputulwa ca mabuula caliputulwe no kusendwa mu cipe ca glasi icashingulwikwa ica 4-ml, kabili umuputule wa mutwe walisuminishiwe ukulongana mu kati ka maawala 5. Mu nshita ya kupima, cila cipe calipooselwe no mumana wa malita yabili/inshita ya mupashi uwa busaka pa maminiti 8, uwali kale uwapitile mu cipe ca kucincimusha icapeelwe na Sensor Sense ku kufumyapo CO2 na menshi.
Amashiwi ayanono ayalembelwe mu (35) no kusungwa mu cifulo ca mashiwi aya pa fya sayansi (NCBI) Icifulo ca mashiwi ayatuntulu aya misango ya fimenwa (inambala ya kwingililamo GSE30287). Ilyashi ilyalingana na mabuula ayaletwa no kundapa kwa W + OSMs no kucenjela ukwabula ukuonaika fyafuminemo kuli ili isambililo. Ubukulu bwa ciko ni log2. Ilyo ukufwailisha kwa fipendo takulacitika, umutande wa ntanshi walipilibulwa no kulungikwa ukufika kuli 75th pesenti ukubomfya ubupe bwa R.
Ukukonkana kwa RNA ukwa kubalilapo (RNA-seq) ukwa misango ya Nicotiana kwafumine ku fitabo fya NCBI ifya kubelenga ifipi (SRA), inambala ya mulimo ni PRJNA301787, iyo yashimikilwe na Zhou na bambi. (39) no kutwalilila nga fintu calondolwelwe muli (56). Ilyashi lya kupangapanga ilyabomfiwa na W + W, W + OSM na W + OSS1 ilyapalana ne misango ya Nicotiana lyasalilwe ku kupitulukamo muli ili isambililo, kabili lyabomfiwa mu nshila ikonkapo: Icakubalilapo, ukubelenga kwa RNA-seq ukwabula ukubomfya kwapilibulwe mu musango wa FASTQ. HISAT2 ilapilibula FASTQ ku SAM, kabili ifibombelo fya SAM filapilibula amafailo ya SAM mu mafailo ya BAM ayatantikwa. StringTie ilabomfiwa ku kupenda imimonekele ya fimenwa, kabili inshila ya iko iya mimonekelemo ni iyo kuli ifiputulwa pa fipimfya fya mushinku amakana pa fipimfya fya mamilioni ifyakonkana ifyalembelwe.
Iciputulwa ca nshita ica kufwailisha (150 mm x 2.1 mm; ubukulu bwa fipimfya 2.2 μm) icabomfiwa mu kufwailisha ne ciputulwa ca nshita ica 4 mm x 4 mm ica kucingililamo cikwata ifintu fimo fine. Ici ciputulwa ca nshita icakonkapo cibomfiwa mu nshila ya kufwailishamo amenshi ayasuma nga nshi (UHPLC): 0 ukufika kuli 0.5 amaminiti, isocratic 90% A [ameshi ayabula ama-ion, 0.1% (v/v) acetonitrile na 0% 0.05% iya asidi wa formiki); 0.5 ukufika ku maminiti 23.5, umuputule wa kufimbilikisha ni 10% A na 90% B, ukulingana; 23.5 ukufika kuli 25 amaminiti, ukulingana 10% A na 90% B. Ukupita kwa menshi ni 400μl/min. Pa kufwailisha konse ukwa MS, pongoleni umulopa wa mu cipimo mu cipimo ca nshita ya kuulukila (qTOF) icakwata intuntuko ya kusamba iya maka iyabomba mu nshila iisuma iya kufwailisha (amaka ya muputule, 4500 V; umuputule wa muputule 130 V ; Ukutenta kwa muputule wa kuuma 200°C;
Ukucita ukufwailisha kwa fiputulwa fya MS / MS (ukukonkapo ukuitwa MS / MS) ukwabula ubupilibulo nelyo ukwabula ukupusanako ukufuma ku fyebo pa kuti usange amashiwi ya mipangilwe pa lwa mibele ya fya kulya iyaishibikwa yonse. Icilangililo ca nshila ya MS / MS iyabula ukusalulula cishintilila pa cine ca kuti quadrupole ili ne windo lya kupaatulako ubukulu nga nshi [eico, tontonkanyeni pa fishibilo fyonse ifya bukulu-ku-ku-kulipila (m / z) nga ifiputulwa]. Pa mulandu uyu, pa mulandu wa kuti icibombelo ca Impact II tacakwete amaka ya kupanga ukutentemuka kwa CE, ukufwailisha ukwaibela ukwafulilako kwacitilwe ukubomfya ukulundako kwa maka ya kukansana ayaletwa no kukansana (CE) imitantikile. Mukucefyako, intanshi ukupituluka mu cilangililo ukupitila mu UHPLC-ukubomfya amafuta ya mulilo / qTOF-MS ukubomfya inshila imo iya kupiminako ubukulu (imibele ya kupaatukana iyacepa iyapangwa ukupitila mu kupaatukana kwa mu ntulo), ukufwailisha ukufuma kuli m / z 50 ukufika kuli 1500 pa kubwelelamo kwa 5 Hz. Ukubomfya nitrogen nga umulilo wa kusansalikwa ku kufwailisha kwa MS / MS, no kucita ifipimo fyaibela pa fikonkelepo fine ifyapusanapusana ifya kusansalikwa-ifyalenga ukusansalikwa: 20, 30, 40, na 50 eV. Mu nshita yonse iya kupima, quadrupole ili ne windo lyakulisha ilya kupaatulako ubukata, ukufuma pali m / z 50 ukufika kuli 1500. Ilyo umubili wa ku ntanshi m / z no kwesha kwa bukulu bwa kupaatukana kwabikwa kuli 200, umusango wa bukulu ulabomba ukwabula ukupita mu mbali ukupitila mu cibombelo ca kubomfya programu na 0 Da. Ukufwailisha ifiputulwa fya bukulu nga mu musango umo uwa bukulu. Ukubomfya umuti wa sodium (50 ml wa asidi wa formic, 200 ml wa menshi ya NaOH) ku kupima ubukulu bwa menshi. Ukubomfya ubupiina bwa Bruker ubwalinga nga nshi, failo ya fyebo ilapimwa panuma ya kubomfya imisango yalinga mu nshita iyapeelwa. Ubomfye umulimo wa kutuma ku nse uwa programu wa kupitulukamo mu fyebo v4.0 (Brook Dalton, Bremen, Germany) ku kwalula amafailo ya fyebo ayashipa mu musango wa NetCDF. Iciputulwa ca mashiwi ya MS/MS calisungwa mu cifulo ca mashiwi icaisulwa ica fya kulya ifya mweo (www.ebi.ac.uk) ne nambala ya kwingililamo. 1471
MS / MS ukulongana kuti kwaishibikwa ukupitila mu kupituluka mu bwampano pakati ka MS1 na MS / MS ifishibilo fya musango wa maka ayacepa na ayakulisha aya kukansana na mafunde ayapya ayabomfiwa. Icitabo ca R cibomfiwa ku kwishiba ukupitulukamo kwapalana ukwa kwakanya kwa cishinka ca kubalilapo ku cipe, kabili icitabo ca C# (icabula ukusalulula-MS-MS-ukulonganika-umupaipi) cibomfiwa ku kufikilisha amafunde.
Pa kuti tucefyeko ifilubo fya bufi ifisuma ifiletwa ne ciunda ca ku numa no kulanshanya kwa bufi ukwaletwa no kusanga ifintu fimo ifya m / z mu filangililo fye ifinono, tulabomfya “intanshi iyaisulamo” umulimo wa R pack XCMS (pa kulungika ukukalipa kwa pa numa) Ififwile ukubomfiwa ku kubwesha “peak iyabikwa pa numa) Ilyo umulimo wa pa muulu wa kufikilisha ulebomfiwa, kucili ifipimo ifingi ifya “0′′ ifya maka mu citabo ca fishinka ifingakuma ukupenda kwa bucibusa. imitengo ya kucincimusha ne cipimo ca ku numa icapendelwe Na kabili twatontonkenye fye pa fishinka ifyo ukucincimusha kwa fiko kwacila imiku itatu pa cipimo ca ku numa kabili twafimwene ukuti “ifipimo fya cine cine.” Pa kupenda kwa PCC, ifishibilo fye fya m / z ifya cilangililo ca ntanshi (MS1) ne fiputulwa fya fishinka ifyakwata ukufika kuli cinekonsekonse ifya cine cine ifimonwa.
Nga cakuti ubukulu bwa cilangililo conse bwapalana no kucefyako ubukali bwa cilangililo cimo cine icabikwa mu maka ayacepa nangu ayakulisha aya kukansana, kabili icintu tacilembelwe nge isotope peak na CAMERA, kuti calondolwa nafimbi. Lyena, ukupitila mu kupenda fyonse ifingacitika ifyakubalilapo-ifyapangwa fibili muli 3 s (inshita iyalinga iya kusunga iwindo lya kusunga pa muulu), ukupitulukamo kwapalana kulacitwa. Ilyo fye umutengo wa m/z walicepa ukucila pa mutengo wa ntanshi kabili ukuputulwa kwa MS/MS kwacitika mu cifulo cimo cine ica cilangililo mu ciputulwa ca fishinka nga fintu umutengo wa ntanshi ukufuma uko wafumine, e lyo cimonwa nge ciputulwa.
Ukushintilila pali aya mafunde yabili ayayanguka, tulafumyamo ifiputulwa fyalumbulwa ifyakwata imitengo ya m / z iyakulisha ukucila m / z iya cishibilo ca kubalilapo icaishibikwa, kabili ukushintilila pa cifulo ca cilangililo apo ica kubalilapo cimoneka ne ciputulwa calumbulwa. Kabili kuti cabako ukusala imibele isuma iyapangwa na ifiputulwa ifingi ifya mu ntulo ifipangwa mu musango wa MS1 nga ifishinka fya kubalilapo, eico ukupanga ifiputulwa fya MS / MS ifyabulamo. Pa kuti tucefyeko uku kukanakonkapo kwa fishinka, nga ca kuti ukupalana kwa NDP ukwa misango ya misango kwacila pali 0.6, kabili fyaba mu “bumba lya pc” ilyalembelwe na CAMERA, tukafibika pamo. Mukulekelesha, twalonganika fyonse fine ifyasangwa ifya CE ifikuma ku ca kubalilapo ne fiputulwa mu ciputulwa ca kulekelesha ica misango yalekanalekana ukupitila mu kusalapo intanshi iyakulisha pa kati ka nsonsela shonse ishalinga ne cipimo cimo cine ica m / z pa maka ya kukansana ayapusanapusana. Intampulo shakonkapo isha kubomfya shashintilila pa cishinka ca misango ya misango kabili ukubikako amano ku mibele ya CE iyapusanapusana ilekabilwa ku kucilikila ukukansana, pantu ifiputulwa fimo kuti fyasangwa fye pe samba lya maka ya kukansana ayalinga.
RDPI (30) yabomfiwe ku kupenda ukukanakonka kwa mibele ya fya kulya. Ukulekanalekana kwa misango ya fya kulya (Hj index) kwafuma ku buvule bwa MS / MS aba kubalilapo ukubomfya Shannon entropy iya MS / MS ukusabankanya imiku iingi ukubomfya ukulingana kwakonkapo ukwalondolwelwe na Martínez na bambi. (8). Hj = -∑i = 1mPijlog2 (Pij) apo Pij alingana ne misango yalinga iya MS / MS mu cilangililo ca j (j = 1, 2, ..., m) (i = 1, 2, ..., m) t).
Ukulingana kwa fya kulya (Si index) kwalondolwelwa nga ukulanga ubushininkisho bwa MS / MS iyapeelwa ukulingana na imiku iingi pakati ka ifilangililo ifitontonkanishiwapo. Ukulungatika kwa MS/MS kwapendelwa nga Si = 1t (∑j = 1tIcipimo2Icipimo)
Ubomfye inshila ikonkapo ku kupima umusango wa δj uwalinga uwa cila cilangililo ca j, kabili umutande wa MS / MS uwalinga δj = ∑i = 1mPijSi .
Imisango ya MS / MS yalilungamikwa mu fibili fibili, kabili ukupalana kwapendelwe ukulingana na ma score yabili. Icakubalilapo, ukubomfya NDP iyalinga (na kabili iyaishibikwa nga inshila iyalinga iya cosine), bomfyeni ifipimo ifikonkelepo ku kupenda ukupalana kwa fiputulwa pakati ka misango NDP = (∑iS1 na S2WS1, iWS2, i) 2 i imininako ubukata ukulingana na maka ya pa muulu ukuti ubupusano bwa pa muulu wa i-th ubwalinga pa kati ka misango ibili bwacepako ukucila pali 0.01 Da. Ukulemana kwapendelwe nga fintu cikonkelepo: W = [ukucincimuka kwa pa muulu] m [ubusuma] n, m = 0.5, n = 2, nga fintu MassBank yasosa.
Inshila ya bubili iya kupiminamo yalibomfiwe, iyabikilemo ukupituluka mu NL iyakanishiwa pakati ka MS / MS. Pa kupwisha ici, twabomfeshe imitantikile ya 52 NL iyasangwa ilingi line mu nshita ya MS iya kupaatukana mu tandem, na NL iyalinga nga nshi (ifailo lya fishinka S1) ilyalembelwe kale ku MS / MS umusango wa fipimo fya bubili ifya misango ya Nepenthes iyacepa ( 9, 26 ). Panga umusango wa babili uwa 1 na 0 kuli cila MS/MS, ukulingana na nomba na ifishabako ifya NL imo ukulingana. Ukushintilila pa kupashanya ubutali bwa Euclidean, amano ya kupashanya aya NL yapendelwa kuli cila babili babili aba NL.
Pa kucita ukulonganika kwabili, twabomfeshe umuputule wa R DiffCoEx, uwashintilila pa kulunduluka kwa Kupituluka mu Kupima kwa Mutundu wa Muntu (WGCNA). Ukubomfya NDP na NL ukupenda ifipimo fya MS / MS, twabomfeshe DiffCoEx ku kupenda ifipimo fya kulinganya ifya kulinganya. Ukulonganika kwa fibili kulacitwa ukupitila mu kubika “icipimo ca kucefyako” ku nshila = “ukusankanishiwa”, ukucefyako ubutali = 0.9999, ukuputula kwa mu kati = T, no kucefyako ubukulu bwa cilonganino = 10. (57); Iciputulwa ca mapulogalamu ya R WGCNA ayafwaikwa kuti casangwa mu citabo ca WGCNA.
Pa kuti tucite ukufwailisha kwa MS / MS, twapendele ukuminkanya kwa misango yabili ukulingana ne misango ya NDP na NL iyapalana, kabili twabomfeshe programu wa Cytoscape ku kumona umusango wa mibombele ukubomfya imitantikile ya fimenwa mu citabo ca mipangilwe ya mipangilwe ya CyFilescape yFiles.
Bomfyeni umusango wa R 3.0.1 ku kucita ukufwailisha kwa fipendo pa fyebo. Ubucindami bwa mipendelo bwapiminwe ukubomfya ukupitulukamo kwa nshila shibili ukwa kwaluka (ANOVA), ukukonkwapo no kwa Tukey ukwa cine cine ukwapusana (HSD) ukufwailisha kwa pa numa. Pakuti twishibe ubupusano pakati ka miti ya fyakulya ifya miti no kucenjela, ukusabankanya kwa micila ibili ukwa mabumba yabili aya filangililo ifyakwata ukwaluka kumo kwine kwapitulwikwemo ukubomfya ukufwailisha kwa Student's t.
Pa lwa fishinka fyalundwapo ifya muli ici cipande, mukwai moneni pa Intaneti.
Ici cipande caishibikwa icasalanganishiwa ukupitila mu mafunde ya Citupa ca Kupanga-Icabula Amakwebo, icasuminisha ukubomfya, ukusabankanya no kupanga cipya cipya mu nshila iili yonse, nga ca kuti ukubomfya kwa kulekelesha te kwa kusanga indalama kabili icishinka ca kuti umulimo wa kubalilapo walilungama. Kuloshako.
Ishiba: Tulemulomba fye ukulemba akeyala kenu aka email pakuti umuntu uo mulepandako amano kwi buula aishibe ukuti mulefwaya ukuti amone email kabili te spam. Tatukakwate amakeyala ya email ayali yonse.
Ici cipusho cibomfiwa ku kwesha nga uli mutandashi no kucingilila ukutuma kwa spam ukwaibela.
Amashiwi ayasambilishiwa yapeela indalama sha calo conse isha kulinganya ifyakupangapanga ifya pa lwakwe no kusobela ifyakucingilila ifyakwesha.
Amashiwi ayasambilishiwa yapeela indalama sha calo conse isha kulinganya ifyakupangapanga ifya pa lwakwe no kusobela ifyakucingilila ifyakwesha.
©2021 Ibumba lya ku America ilya Kutungulula Sayansi. insambu shonse shasuminishiwa. AAAS ni cibusa wa kwa Hinari, Agora, Oare, KORA, CLOCKSS, Ukukonkana no Kupenda. Ukutunguluka kwa Sayansi 2375-2548.